连接药物相互作用机制与临床严重程度分级的酶解析数据集

1,900个无序药物对、240种药物和3,072条药物对–蛋白–方向记录的快照,将药物相互作用机制与临床严重程度分级关联起来

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zenodo
2026-10-05 更新
浏览 23
基因组分类药物相互作用临床严重程度分级DDInterUniProt蛋白质靶点药物配对数据重建脚本
An enzyme-resolved dataset linking drug interaction mechanisms to clinical severity grades

基本信息

模态
基因组
大小
0.001272565 GB
任务类型
分类
许可
Source-specific terms and author-created code licence
创建/更新时间
2026-10-05
版本
2.3.0

资源简介

连接药物相互作用机制与临床严重程度分级的酶解析数据集

1,900个无序药物对、240种药物和3,072条药物对–蛋白–方向记录的快照,将药物相互作用机制与临床严重程度分级关联起来

An enzyme-resolved dataset linking drug interaction mechanisms to clinical severity grades

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):1,900个无序药物对、240种药物和3,072条药物对–蛋白–方向记录的快照,将药物相互作用机制与临床严重程度分级关联起来。一个经SHA验证的脚本从归因和448化合物标识桥接快照中重建所有八个主记录列。一次官方UniProt审计(2026_03版)将所有35个蛋白登录号解析为审阅人类基因,并修正两个源标签:Q4U2R8为SLC22A6/OAT1,Q8TCC7为SLC22A8/OAT3。DDInter严重程度分级不再分发;scripts/rebuild_severity.py从用户自己的DDInter 2.0下载中本地重建它们,并根据记录的指纹进行验证。该发布包含完整的九基因描述性分析及一个不相交比较器、单基因敏感性分析、聚合参考成员计数、数据字典、来源清单、校验和、验证

【主题与分类】

主题标签:药物相互作用、临床严重程度分级、DDInter、UniProt、蛋白质靶点、药物配对、数据重建脚本。本站分类:化学诱发性障碍/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.23169653

使用许可:Source-specific terms and author-created code licence。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.3 MB。

数据说明

包含1,900个无序药物对、240种药物和3,072条药物对-蛋白质-方向记录的快照,将药物相互作用机制与临床严重程度分级关联起来。一个经SHA验证的脚本从归因快照和448种化合物标识符桥接快照中重建全部八个主记录列。一次官方UniProt审计(2026_03版本)将所有35个蛋白质登录号解析为经过审阅的人类基因,并更正了两个来源标签:Q4U2R8为SLC22A6/OAT1,Q8TCC7为SLC22A8/OAT3。DDInter严重程度分级不再分发;scripts/rebuild_severity.py从用户自行下载的DDInter 2.0中在本地重建这些分级,并依据记录的指纹进行验证。该发布版本包含完整的九基因描述性分析及一个不相交比较组、单基因敏感性分析、聚合参考成员计数、数据字典、来源清单、校验和、验证代码以及一个离线浏览器。作者编写的代码采用MIT许可;作者创建的文档和图表采用CC BY 4.0许可;第三方输入保留其来源条款(见LICENSES.md)。为同名的《Scientific Data》数据描述符提供支持。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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