先心病全心与大血管MR分割数据
HVSMR 2016 数据集包含与永存动脉干相关的图像资料,可用于图像分割、特征提取、风险建模和公开基准验证,适合疾病数据集检索、临床研究和算法开发。

基本信息
资源简介
先心病全心与大血管MR分割数据
【一句话概览】
HVSMR 2016 是 MICCAI 先天性心脏病三维心血管 MRI 全心与大血管分割研讨会。数据为波士顿儿童医院临床采集的 3D CMR 图像,涵盖多种先天性心脏缺陷,部分受试者接受过干预。采用 1.5T 扫描仪轴位无对比剂 SSFP 序列成像,自由呼吸并用心电与呼吸导航门控去除运动。训练集图像尺寸与间距因受试者而异,平均为 390×390×165 和 0.9×0.9×0.85 mm。血池与心室心肌由受训标注者手动分割并经两名临床专家验证,分割在近似短轴视图完成后变换回原始轴位空间(来源 segchd.csail.mit.edu)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《HVSMR 2016》。
【数据内容】
源站原始描述:HVSMR 2016: MICCAI Workshop on Whole-Heart and Great Vessel Segmentation from 3D Cardiovascular MRI in Congenital Heart Disease. The 3D cardiovascular magnetic resonance (CMR) images were acquired during clinical practice at Boston Children’s Hospital, Boston, MA, USA. Cases include a variety of congenital heart defects. Some subjects have undergone interventions. Imaging was done in an axial view on a 1.5T scanner (Phillips Achieva) without contrast agent using a steady-state free precession (S…
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):HVSMR 2016:MICCAI 先天性心脏病三维心血管MRI全心与大血管分割研讨会。三维心血管磁共振(CMR)图像是在美国马萨诸塞州波士顿波士顿儿童医院的临床实践中采集的。病例包括多种先天性心脏缺陷。部分受试者接受过干预。成像在1.5T扫描仪(Phillips Achieva)上以轴位视图进行,未使用造影剂,采用稳态自由进动(SSFP)脉冲序列。受试者在扫描期间自由呼吸,并使用ECG和呼吸导航门控来消除心脏和呼吸运动(TR = 3.4 ms,TE = 1.7 ms,α = 60˚)。不同受试者的图像尺寸和图像间距各不相同,在完整容积训练数据集中平均分别为390 x 390 x 165和0.9 x 0.9 x 0.85 mm。血池和心室心肌的手动分割由一名经过培训的标注者完成,并由两名临床专家验证。分割在近似短轴视图中进行,然后变换回原始图像空间(轴位视图)。手动分割时考虑了所有三个平面,但短轴视图中的分割质量是决定性因素。血池类别包括左心房、右心房、左心室、右心室、主动脉、肺静脉、肺动脉以及上腔静脉和下腔静脉。血管(主动脉除外)仅延伸至其起源处几厘米:这是因为当三维心脏表面模型用于手术规划时,过长的血管会造成干扰。心肌类别包括围绕两个心室的厚肌肉以及它们之间的室间隔。冠状动脉不包括在血池类别中,如果它们在心室心肌内走行,则标记为心肌。更新:应要求,我们已发布每个受试者的裁剪图像和短轴图像。近似短轴视图仅使用二尖瓣和心尖手动定义,因此围绕该轴存在残余旋转,且在不同受试者之间不一致。因此,挑战赛参与者在训练/测试数据方面有三种选择:(1)轴位完整容积图像,即原始采集图像(2)裁剪后的轴位图像(3)已变换为近似短轴的裁剪图像
【主题与分类】
主题标签:congenital heart disease、3D cardiovascular MRI、whole-heart segmentation、great vessel segmentation、blood pool、ventricular myocardium、MICCAI 2016。
【适用方向】
影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。
【获取与许可】
源站页面:https://segchd.csail.mit.edu/data.html
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://segchd.csail.mit.edu/data.html
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
复杂先心病3D MR数据,可用于永存动脉干相关共同动脉干和大血管分割。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




