血管紧张素II输注小鼠升主动脉瘤影像数据集:形成、进展与局灶性夹层的作用-80690

主题标签:心血管系统疾病、胸主动脉瘤、升主动脉瘤、Ang II 输注小鼠、micro-CT、PCXTM、局灶性夹层、Mimics

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医学影像图像分割心血管系统疾病胸主动脉瘤升主动脉瘤Ang II 输注小鼠micro-CTPCXTM局灶性夹层Mimics
Imaging Data for "Ascending aortic aneurysm in angiotensin II- infused mice: formation, progression and the role of focal dissections"

基本信息

模态
医学影像
大小
23.735723139 GB
任务类型
图像分割
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

血管紧张素II输注小鼠升主动脉瘤影像数据集:形成、进展与局灶性夹层的作用

该数据集为血管紧张素II(Ang II)输注小鼠升主动脉瘤研究提供了配套的影像文件,对应2016年发表于ATVB的论文《Ascending aortic aneurysm in angiotensin II-infused mice: formation, progression and the role of focal dissections》。数据集收录了体内micro-CT与离体同步辐射相位对比X射线断层显微成像(PCXTM)两类影像,覆盖基线及Ang II输注后多个时间点,可用于观察升主动脉瘤的形成、进展及局灶性夹层。所有文件均需在Mimics软件中打开,命名遵循“技术_编号_时间点_asc.mcs”的规则。该数据集由Zenodo发布,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可,面向心血管系统疾病与胸主动脉瘤研究领域。

【数据集背景】

该数据集服务于一项关于Ang II输注小鼠升主动脉瘤的研究,论文发表于ATVB(2016年)。研究关注升主动脉瘤的形成、进展以及局灶性夹层在其中的作用。数据集所属分类为心血管系统疾病/胸主动脉瘤,来源站为doi.org。数据集发布时间为2019年,发布机构为Zenodo。作者包括Trachet, Bram、Piersigilli, Alessandra、Fraga-Silva, Rodrigo、Aslanidou, Lydia、Sordet-Dessimoz, Jessica、Astolfo, Alberto、Stampanoni, Marco、Segers, Patrick、Stergiopulos, Nikolaos。

【数据内容】

数据集包含该论文的影像文件。文件命名格式为“技术_编号_时间点_asc.mcs”,其中技术可为体内micro-CT或离体同步辐射PCXTM;编号对应实验期间使用的小鼠ID;时间点包括TP0至TP4。TP0对应基线(Ang II输注前),TP1对应Ang II输注3天,TP2对应10天,TP3对应18天,TP4对应28天。小鼠被随机分配到2组(G1和G2),并在4个可能时间点之一后处死。PCXTM影像文件为离体采集。所有已发布文件均需在Mimics(Materialise, Leuven, Belgium)中打开。

【采集与来源】

影像采集技术包括体内micro-CT和离体同步辐射PCXTM。来源站为doi.org,发布机构为Zenodo。源站描述指出,所有文件均以Mimics打开,文件命名包含技术、小鼠ID和时间点信息。小鼠随机分为G1和G2两组,并在TP0至TP4中的一个时间点后处死。PCXTM影像为离体采集。关于具体扫描参数、样本量、图像分辨率等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于心血管系统疾病与胸主动脉瘤相关研究,尤其是升主动脉瘤形成、进展及局灶性夹层的研究。主题标签包括心血管系统疾病、胸主动脉瘤、升主动脉瘤、Ang II输注小鼠、micro-CT、PCXTM、局灶性夹层、Mimics。影像文件可用于在Mimics中进行三维重建、形态学观察和比较分析,支持对Ang II输注后不同时间点主动脉变化的评估。

【使用方法】

所有文件需在Mimics(Materialise, Leuven, Belgium)中打开。用户可根据文件名中的技术、小鼠ID和时间点信息筛选所需影像。技术字段区分体内micro-CT与离体PCXTM;编号字段对应实验期间的小鼠ID;时间点字段对应TP0至TP4。小鼠分组信息为G1和G2,但源站未提供各组具体对应关系。使用时应遵循Creative Commons Attribution 4.0 International许可要求。

【质量与限制】

源站未提供关于图像质量、分辨率、扫描参数、样本量、缺失数据或技术伪影的具体信息。数据集仅包含影像文件,未提供配套的定量测量结果或统计分析方法。PCXTM为离体采集,体内micro-CT为在体采集,两者在样本状态上存在差异。小鼠随机分为G1和G2,并在4个可能时间点之一后处死,但源站未说明每组的具体数量及时间点分布。

【引用与许可】

该数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可。引用时需遵循该许可要求,注明作者与来源。作者为Trachet, Bram、Piersigilli, Alessandra、Fraga-Silva, Rodrigo、Aslanidou, Lydia、Sordet-Dessimoz, Jessica、Astolfo, Alberto、Stampanoni, Marco、Segers, Patrick、Stergiopulos, Nikolaos。发布机构为Zenodo,发布时间为2019年。来源站为doi.org。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.2637744

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 23.74 GB。

数据说明

本数据集包含发表于2016年《ATVB》的手稿“血管紧张素II输注小鼠中的升主动脉瘤:形成、进展及局灶性夹层的作用”的影像文件。所有已发表的文件均需在Mimics(Materialise,比利时鲁汶)中打开。所有文件命名如下:“技术_编号_时间点_asc.mcs”。技术可以是体内微型CT,或离体同步辐射相衬X射线断层显微成像(PCXTM)。小鼠编号与实验期间使用的编号相对应。小鼠随机分为2组(G1和G2),并在4个可能的时间点之一后处死。TP0对应基线(Ang II输注前),TP1对应Ang II输注3天,TP2对应Ang II输注10天,TP3对应Ang II输注18天,TP4对应Ang II输注28天。PCXTM的图像文件为离体图像,且始终对应微型CT可获得的最新时间点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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