SARS-CoV-2感染心肌的炎症激活与免疫细胞浸润主要生物学特征数据集

该数据集是一个基于转录组测序数据的生物信息学资源,主要包含SARS-CoV-2感染心肌细胞的基因表达谱,通过分析差异表达基因、miRNA靶向关系、炎症信号通路富集和免疫细胞浸润,揭示了新冠病毒感染导致心肌炎症激活和免疫细胞(如幼稚B细胞)浸润的关键生物学特征,适用于研究COVID-19相关心肌炎的分子机制、心脏免疫微环境及药物靶点预测。

Zuo, Pengfei; Yang, Mingming; Su, Yamin; Zhang, Rui; Chen, Xi; Ma, Genshan; Li, Yongjun; Ji, Zhenjun; Zuo, Wenjie; Qu, YangyangZuo, Pengfei; Yang, Mingming; Su, Yamin; Zhang, Rui; Chen, Xi; Ma, Genshan; Li, Yongjun; Ji, Zhenjun; Zuo, Wenjie; Qu, Yangyang
Taylor & Francis Group
2024-03-21 更新
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新冠病毒心肌炎机制心脏免疫微环境分析

基本信息

创建/更新时间
2024-03-21

资源简介

该数据集是一个基于转录组学的生物信息学数据集,旨在探究SARS-CoV-2感染心肌的生物学特征。数据集包含SARS-CoV-2感染的心肌细胞(CMs)的转录组测序数据,通过生物信息学工具分析,识别出86个差异表达基因(DEGs)和15个靶向60个基因的miRNAs。功能富集分析显示这些基因主要富集于炎症信号通路,蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析鉴定出CCL2、CXCL8等枢纽基因。此外,数据集还包含对SARS-CoV-2感染心脏中免疫细胞浸润的分析,发现幼稚B细胞显著增加,并预测了SRC抑制剂saracatinib可能对抗SARS-CoV-2诱导的心功能障碍。数据来源于公开的转录组数据,适用于研究新冠病毒相关心肌炎的分子机制、心脏免疫微环境及潜在治疗靶点。

原始链接

https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Inflammatory_activation_and_immune_cell_infiltration_are_main_biological_characteristics_of_SARS-CoV-2_infected_myocardium/18551244/1

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数据说明

该数据集是一个基于转录组学的生物信息学数据集,旨在探究SARS-CoV-2感染心肌的生物学特征。数据集包含SARS-CoV-2感染的心肌细胞(CMs)的转录组测序数据,通过生物信息学工具分析,识别出86个差异表达基因(DEGs)和15个靶向60个基因的miRNAs。功能富集分析显示这些基因主要富集于炎症信号通路,蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析鉴定出CCL2、CXCL8等枢纽基因。此外,数据集还包含对SARS-CoV-2感染心脏中免疫细胞浸润的分析,发现幼稚B细胞显著增加,并预测了SRC抑制剂saracatinib可能对抗SARS-CoV-2诱导的心功能障碍。数据来源于公开的转录组数据,适用于研究新冠病毒相关心肌炎的分子机制、心脏免疫微环境及潜在治疗靶点。

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