SARS-CoV-2感染心肌的炎症激活与免疫细胞浸润主要生物学特征数据集
该数据集是一个基于转录组测序数据的生物信息学资源，主要包含SARS-CoV-2感染心肌细胞的基因表达谱，通过分析差异表达基因、miRNA靶向关系、炎症信号通路富集和免疫细胞浸润，揭示了新冠病毒感染导致心肌炎症激活和免疫细胞（如幼稚B细胞）浸润的关键生物学特征，适用于研究COVID-19相关心肌炎的分子机制、心脏免疫微环境及药物靶点预测。
基本信息
资源简介
SARS-CoV-2感染心肌的炎症激活与免疫细胞浸润主要生物学特征数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Inflammatory activation and immune cell infiltration are main biological characteristics of SARS-CoV-2 infected myocardium》。配套论文《Inflammatory activation and immune cell infiltration are main biological characteristics of SARS-CoV-2 infected myocardium》发表于 Bioengineered（2022），DOI：10.1080/21655979.2021.2014621。项目资助方：This study was supported by National Natural Science Foundation of China (grant number 81870213), Jiangsu Provincial Key Medical Discipline (Laboratory ZDXKA2016023).。源站首次发布：2022-01-17。
【数据内容】
源站原始描述：The severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) can target cardiomyocytes (CMs) to directly invade the heart resulting in high mortality. This study aims to explore the biological characteristics of SARS-CoV-2 infected myocardium based on omics by collecting transcriptome data and analyzing them with a series of bioinformatics tools. Totally, 86 differentially expressed genes (DEGs) were discovered in SARS-CoV-2 infected CMs, and 15 miRNAs were discovered to target 60 genes. Fun…
主表 Supplementary Table 1.csv 含 7 列、样本前 140 行结构完整。
主表 Supplementary Table 2.csv 含 6 列、样本前 2000 行结构完整。
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 168.55 KB。Supplementary Table 1.csv：text/plain，9.89 KB。Supplementary Table 2.csv：text/plain，158.66 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.18551244.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Biochemistry、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Immunology。主题标签：SARS-CoV-2、cardiomyocyte、heart injury、COVID-19、bioinformatics。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。源站学科分类标注为 Biochemistry、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Immunology。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Inflammatory_activation_and_immune_cell_infiltration_are_main_biological_characteristics_of_SARS-CoV-2_infected_myocardium/18551244
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Inflammatory activation and immune cell infiltration are main biological characteristics of SARS-CoV-2 infected myocardium. Taylor & Francis. Zhang, Rui; Chen, Xi; Zuo, Wenjie; Ji, Zhenjun; Qu, Yangyang; Su, Yamin; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2024-03-21，引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放公开下载
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是一个基于转录组学的生物信息学数据集，旨在探究SARS-CoV-2感染心肌的生物学特征。数据集包含SARS-CoV-2感染的心肌细胞（CMs）的转录组测序数据，通过生物信息学工具分析，识别出86个差异表达基因（DEGs）和15个靶向60个基因的miRNAs。功能富集分析显示这些基因主要富集于炎症信号通路，蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析鉴定出CCL2、CXCL8等枢纽基因。此外，数据集还包含对SARS-CoV-2感染心脏中免疫细胞浸润的分析，发现幼稚B细胞显著增加，并预测了SRC抑制剂saracatinib可能对抗SARS-CoV-2诱导的心功能障碍。数据来源于公开的转录组数据，适用于研究新冠病毒相关心肌炎的分子机制、心脏免疫微环境及潜在治疗靶点。
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