基于大鼠血液的心肌缺血转录组学分析
该数据集包含大鼠血液的转录组学数据，通过RNA测序技术获取了3只心肌缺血模型大鼠和3只正常对照大鼠的基因表达谱，数据模态为基因表达矩阵和转录本序列。其主要用途是分析心肌缺血相关的差异表达基因、识别新转录本，并利用GO富集分析探索免疫反应和应激通路在疾病中的作用，为心血管疾病的分子机制研究提供基础数据支持。
基本信息
资源简介
基于大鼠血液的心肌缺血转录组学分析
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Transcriptomic Analysis of Myocardial Ischemia Using the Blood of Rat》。配套论文《Transcriptomic Analysis of Myocardial Ischemia Using the Blood of Rat》发表于 PLOS ONE（2015），DOI：10.1371/journal.pone.0141915。源站首次发布：2015-11-05。
【数据内容】
源站原始描述：Myocardial ischemia is a pathological state of heart with reduced blood flow to heart and abnormal myocardial energy metabolism. This disease occurs commonly in middle aged and elderly people. Several studies have indicated that the rat was an appropriate animal model used to study myocardial ischemia. In this study, in order to gain insights into the pathogenesis of myocardial ischemia, we sequenced the transcriptomes of three normal rats as control and the same number of myocardial ischemia ra…
【数据结构与技术规格】
文件数 7 个，合计 1.92 MB。S1_Fig.png：image/png，172.36 KB。S2_Fig.png：image/png，152.82 KB。S1_File.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，671.06 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0141915。
【主题与分类】
源站学科分类：Uncategorised。主题标签：gene expression values、Illumina HiSeq 2000.、ischemia rats、Rat Myocardial ischemia、rpkm。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Uncategorised。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Transcriptomic_Analysis_of_Myocardial_Ischemia_Using_the_Blood_of_Rat_/1595063
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Hou, Jincai; Fu, Jianhua; Li, Dan; Han, Xiao; Li, Lei; Song, Wenting; et al. (2016). Transcriptomic Analysis of Myocardial Ischemia Using the Blood of Rat. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-03，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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数据说明
该数据集是一个针对心肌缺血（一种因心脏血流减少和心肌能量代谢异常导致的病理状态）的转录组学研究数据集。数据集包含通过Illumina HiSeq 2000平台测序获得的6只大鼠（3只心肌缺血模型大鼠作为病例组，3只正常大鼠作为对照组）的血液转录组数据。研究内容包括基因表达值计算、基于RPKM的差异表达基因鉴定、GO富集分析以及新转录本预测。分析发现，与对照组相比，心肌缺血大鼠中有707个基因上调、21个基因下调（变化倍数≥2倍），并分别在病例组和对照组中识别出1,703和1,552个新转录本。该数据集主要用于探究心肌缺血的发病机制，特别是免疫反应、应激反应及相关通路在疾病中的作用，为心血管疾病研究提供基因表达层面的依据。
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