基于大鼠血液的心肌缺血转录组学分析
该数据集包含大鼠血液的转录组学数据，通过RNA测序技术获取了3只心肌缺血模型大鼠和3只正常对照大鼠的基因表达谱，数据模态为基因表达矩阵和转录本序列。其主要用途是分析心肌缺血相关的差异表达基因、识别新转录本，并利用GO富集分析探索免疫反应和应激通路在疾病中的作用，为心血管疾病的分子机制研究提供基础数据支持。
创建时间2016-01-15
更新时间2016-01-15
原始链接
https://figshare.com/articles/dataset/_Transcriptomic_Analysis_of_Myocardial_Ischemia_Using_the_Blood_of_Rat_/1595063
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资源简介
该数据集是一个针对心肌缺血（一种因心脏血流减少和心肌能量代谢异常导致的病理状态）的转录组学研究数据集。数据集包含通过Illumina HiSeq 2000平台测序获得的6只大鼠（3只心肌缺血模型大鼠作为病例组，3只正常大鼠作为对照组）的血液转录组数据。研究内容包括基因表达值计算、基于RPKM的差异表达基因鉴定、GO富集分析以及新转录本预测。分析发现，与对照组相比，心肌缺血大鼠中有707个基因上调、21个基因下调（变化倍数≥2倍），并分别在病例组和对照组中识别出1,703和1,552个新转录本。该数据集主要用于探究心肌缺血的发病机制，特别是免疫反应、应激反应及相关通路在疾病中的作用，为心血管疾病研究提供基因表达层面的依据。
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