肥厚型心肌病单细胞转录组学数据集
该数据集是一个单细胞转录组学数据集,包含来自肥厚型心肌病患者心脏组织的单细胞RNA测序计数表、流式细胞术索引数据和Seurat分析对象,数据模态包括基因表达矩阵和细胞物理参数,主要用于研究肥厚型心肌病的细胞异质性、疾病机制以及心血管疾病的单细胞转录组学分析,支持复现相关研究论文中的图表和结论。
基本信息
资源简介
该数据集是Wehrens等人于2022年在《Cell Reports》发表的论文《Single-cell transcriptomics provides insights into hypertrophic cardiomyopathy》的相关数据文件集合。数据集包含来自多个肥厚型心肌病患者的单细胞RNA测序数据,具体包括:1)Van Rooij样本的计数表(来自5名患者的16个样本),对应GEO编号GSM4103885-GSM4762108;2)Hu等人样本的重新计算计数表(来自Wang等人研究的数据);3)FACS分选的流式细胞术索引数据,包含细胞大小等物理参数;4)两个Seurat对象文件:一个仅包含Wehrens等人样本的Seurat对象,另一个整合了Wehrens、Wang和Litvinukova等人的数据。这些数据经过处理,可直接用于复现论文中的分析和图表,无需从原始FASTQ文件重新映射。该数据集主要应用于心血管疾病研究、单细胞转录组学分析、细胞异质性探索和疾病机制解析等方向。
下载信息
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暂未开放公开下载
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使用方式
数据集获取(Zenodo 公开直链)
源站:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.18206554
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数据说明
该数据集是Wehrens等人于2022年在《Cell Reports》发表的论文《Single-cell transcriptomics provides insights into hypertrophic cardiomyopathy》的相关数据文件集合。数据集包含来自多个肥厚型心肌病患者的单细胞RNA测序数据,具体包括:1)Van Rooij样本的计数表(来自5名患者的16个样本),对应GEO编号GSM4103885-GSM4762108;2)Hu等人样本的重新计算计数表(来自Wang等人研究的数据);3)FACS分选的流式细胞术索引数据,包含细胞大小等物理参数;4)两个Seurat对象文件:一个仅包含Wehrens等人样本的Seurat对象,另一个整合了Wehrens、Wang和Litvinukova等人的数据。这些数据经过处理,可直接用于复现论文中的分析和图表,无需从原始FASTQ文件重新映射。该数据集主要应用于心血管疾病研究、单细胞转录组学分析、细胞异质性探索和疾病机制解析等方向。
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