肥厚型心肌病相关单细胞转录组学计数表与Seurat对象数据集

该数据集包含肥厚型心肌病相关的单细胞转录组学数据,主要提供经过处理的基因表达计数表(TSV格式)、Seurat分析对象(RDS格式)以及流式细胞分选索引数据,数据来源于公开的GEO数据库并覆盖多名患者的样本,可用于复现相关研究中的分析结果、探索心肌细胞异质性、支持心血管疾病的分子机制研究以及单细胞生物信息学方法开发。

Zenodo
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2026-01-12 更新
创建时间2026-01-12
更新时间2026-01-12
原始链接

https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.18206553

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资源简介

该数据集源自Wehrens等人2022年发表于《Cell Reports》的研究论文《Single-cell transcriptomics provides insights into hypertrophic cardiomyopathy》,旨在支持肥厚型心肌病(HCM)的单细胞转录组学分析。数据集包含经过处理的计数表文件(TSV格式)、Seurat对象(RDS格式)以及流式细胞分选(FACS)的索引数据,覆盖来自多个患者的单细胞RNA测序样本。数据来源于公开的GEO数据库(如GSM4103885-GSM4762108等),并经过重新计算和标准化处理,可直接用于复现原文中的分析和图表生成,无需从原始FASTQ文件重新映射。该数据集主要应用于心血管疾病研究、单细胞转录组学分析、细胞异质性探索以及生物信息学方法开发。

提供机构:Zenodo

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影像Count Tables & Seurat Objects for Single-cell Transcriptomics in Hypertrophic Cardiomyopathy