应激诱导的RNA-染色质相互作用促进内皮功能障碍
该数据集整合了单细胞RNA测序、Hi-C和iMARGI三种模态的分子数据，聚焦于高糖和TNFα应激下内皮细胞中RNA-染色质相互作用的动态变化，旨在揭示染色质相关RNA如何调控基因表达并促进内皮功能障碍，为研究糖尿病等疾病的分子机制提供了关键资源。
创建时间2025-09-08
原始链接
https://explore.data.humancellatlas.org/projects/87d52a86-bdc7-440c-b84d-170f7dc346d9
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资源简介
该数据集研究了环境应激（如高糖和TNFα模拟糖尿病常见应激）如何通过调节RNA-染色质相互作用导致内皮细胞功能障碍。数据集包含单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，用于表征基因表达变化；Hi-C数据，用于分析DNA相互作用；以及iMARGI数据，用于检测RNA-染色质相互作用。研究发现，应激诱导了染色体间RNA-染色质相互作用，特别是在超级增强子区域。通过抑制LINC00607 RNA，证实了这种相互作用与内皮功能障碍相关基因（如SERPINE1）表达之间的因果关系。数据集可用于探索染色质相关RNA在基因表达调控中的作用机制，以及内皮功能障碍在糖尿病等疾病中的分子基础。
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