爱尔兰狼犬扩张型心肌病多基因位点关联数据集
该数据集包含爱尔兰狼犬扩张型心肌病病例与对照的基因组关联研究数据,数据模态为基因型与表型信息,通过全基因组关联分析识别出多个与疾病相关的SNP位点,主要用于研究犬类扩张型心肌病的遗传机制、探索相关基因功能以及为动物模型遗传病研究提供数据支持。

基本信息
资源简介
爱尔兰狼犬扩张型心肌病多基因位点关联数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Multiple Loci Are Associated with Dilated Cardiomyopathy in Irish Wolfhounds》。配套论文《Multiple Loci Are Associated with Dilated Cardiomyopathy in Irish Wolfhounds》发表于 PLoS ONE(2012),DOI:10.1371/journal.pone.0036691。源站首次发布:2012-06-25。
【数据内容】
源站原始描述:Dilated cardiomyopathy (DCM) is a highly prevalent and often lethal disease in Irish wolfhounds. Complex segregation analysis indicated different loci involved in pathogenesis. Linear fixed and mixed models were used for the genome-wide association study. Using 106 DCM cases and 84 controls we identified one SNP significantly associated with DCM on CFA37 and five SNPs suggestively associated with DCM on CFA1, 10, 15, 21 and 17. On CFA37 MOGAT1 and ACSL3 two enzymes of the lipid metabolism were l…
【数据结构与技术规格】
文件数 11 个,合计 11.18 MB。Figure_S1.tif:image/tiff,1.00 MB。Figure_S2.tif:image/tiff,698.62 KB。Figure_S3.tif:image/tiff,2.81 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0036691。
【主题与分类】
源站学科分类:Genetics。主题标签:loci、are、dilated、cardiomyopathy、irish、wolfhounds。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Genetics。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Multiple_Loci_Are_Associated_with_Dilated_Cardiomyopathy_in_Irish_Wolfhounds/123547
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Philipp, Ute; Vollmar, Andrea; Häggström, Jens; Thomas, Anne; Distl, Ottmar (2016). Multiple Loci Are Associated with Dilated Cardiomyopathy in Irish Wolfhounds. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是关于爱尔兰狼犬扩张型心肌病(DCM)的基因组关联研究数据。数据集包含106例DCM病例和84例对照样本的基因组信息,通过线性固定和混合模型进行全基因组关联分析,识别出与DCM显著相关的SNP位点。研究在CFA37染色体上发现一个显著关联SNP,在CFA1、10、15、21和17染色体上发现五个提示性关联SNP。这些位点附近涉及脂质代谢相关基因MOGAT1和ACSL3。数据来源于对爱尔兰狼犬这一高发DCM品种的遗传学研究,主要应用于犬类遗传病机制研究、基因组关联分析和动物模型疾病遗传基础探索。
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