H19 lncRNA遗传变异与扩张型心肌病关联数据集
该数据集包含1084名扩张型心肌病患者和751名健康对照的基因型数据,主要研究H19长链非编码RNA中一个特定单核苷酸多态性(SNP)对RNA二级结构的影响及其与疾病的关联,通过计算预测和实验验证相结合的方法,揭示了该遗传变异如何改变RNA结构并可能影响心脏发育调控,为心血管疾病的分子机制研究提供了重要的多模态数据(基因型、RNA结构、临床表型)。
创建时间2021-07-27
更新时间2024-03-21
原始链接
https://tandf.figshare.com/articles/dataset/A_genetic_variant_alters_the_secondary_structure_of_the_lncRNA_H19_and_is_associated_with_dilated_cardiomyopathy/15060842/1
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资源简介
该数据集聚焦于长链非编码RNA H19的遗传变异与扩张型心肌病的关联研究。数据集包含1084名扩张型心肌病患者和751名健康对照的基因型数据,重点关注H19 lncRNA区域的一个单核苷酸多态性(SNP)。通过最小自由能折叠和SHAPE-Seq实验验证,该数据集揭示了该SNP如何显著改变H19 lncRNA的二级结构和热力学概率分布,从而影响其调控功能。该数据集为理解lncRNA结构变异在心血管疾病中的分子机制提供了重要资源,适用于生物信息学、结构生物学和心血管疾病遗传学研究。
提供机构:Witten, Anika; Kääb, Stefan; Rühle, Frank; Arbustini, Eloisa; Angermann, Christiane; Sinner, Moritz F.; Katus, Hugo A.; Hasenfuß, Gerd; Stoll, Monika; Bornberg-Bauer, Erich; Martens, Leonie; Pankuweit, Sabine; Meder, Benjamin
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