人iPSCs分化为平滑肌细胞
该数据集来自omicsdi.org,收录人iPSCs经10天方案分化为诱导型平滑肌细胞(iSMC)的蛋白质组学数据,覆盖整个分化时间进程,并包含iSMC在成骨培养基中培养17天启动钙化的阶段

基本信息
资源简介
人iPSCs分化为平滑肌细胞
该数据集收录了人诱导多能干细胞(iPSCs)向诱导型平滑肌细胞(iSMC)分化过程的蛋白质组学数据。按照源站描述,研究人员采用为期10天的分化方案,将人iPSCs诱导为iSMC表型,并在整个分化时间进程中开展蛋白质组学检测,从而获得起始细胞群与终末细胞群界定清晰的完整数据。蛋白质组学结果验证了iPSCs向iSMCs的分化;与原发性人平滑肌细胞的蛋白质组比较显示,iSMCs与之具有高度相关性。在完成iSMC分化后,研究者将细胞置于成骨培养基中培养17天以启动钙化。该数据集在站内归入心血管系统疾病/冠状动脉疾病分类,来源为omicsdi.org,主题标签包括钙化、平滑肌细胞与Lumos。
【数据集背景】
平滑肌细胞是血管壁的重要组成部分,其表型变化与钙化等血管病理过程密切相关。人诱导多能干细胞为研究平滑肌细胞分化及其后续病理转变提供了可操作的细胞模型。该数据集正是围绕人iPSCs向诱导型平滑肌细胞分化这一过程建立,并在分化完成后进一步引入成骨培养条件以启动钙化,因而同时覆盖了分化与钙化启动两个相互衔接的阶段。数据集被归入心血管系统疾病/冠状动脉疾病分类,主题标签中的“钙化”“平滑肌细胞”也直接对应其研究内容。
【数据内容】
该数据集的核心内容是蛋白质组学数据,覆盖人iPSCs分化为iSMC的整个时间进程。源站描述指出,蛋白质组学检测贯穿全部10天分化方案,目的在于提供稳健且界定明确的起始与终末细胞群体。数据中还包括iSMC在成骨培养基中培养17天启动钙化这一阶段的蛋白质组学信息。主题标签中出现的Lumos指向数据采集所使用的质谱平台类型。除上述内容外,样本数量、具体蛋白鉴定数目、定量指标等细节源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于omicsdi.org。根据源站描述,实验流程为:人iPSCs在10天方案中向iSMC表型分化,期间持续进行蛋白质组学采样;分化完成后,iSMCs在成骨培养基中培养17天以启动钙化。蛋白质组学数据用于验证分化结果,并与原发性人平滑肌细胞进行蛋白质组比较。数据集的英文名称为Human iPSCs differentiated into SMCs。更详细的样本处理、质谱参数与原始文件信息源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究人iPSCs向平滑肌细胞分化的蛋白质组变化,评估分化终末细胞与原发性人平滑肌细胞的相关性,以及考察平滑肌细胞在成骨条件下启动钙化过程中的蛋白质组特征。对于心血管系统疾病尤其是冠状动脉疾病相关的血管钙化机制研究,该数据可作为分化模型与钙化模型的蛋白质组参考。具体分析应用方式需结合数据实际内容确定,源站未提供专门的应用说明。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明。使用者可依据蛋白质组学数据的常规分析流程,围绕分化时间进程与钙化启动阶段进行比较分析,但数据的具体格式、检索方式与配套注释信息源站未提供。
【质量与限制】
源站描述强调,该蛋白质组学数据验证了iPSCs向iSMCs的分化,且iSMCs与原发性人平滑肌细胞高度相关,并指出分化方案提供了稳健、界定明确的起始与终末细胞群体。除此之外,数据质量评估指标、批次信息、重复数量及潜在偏差等源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD032353
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
人诱导多能干细胞(iPSCs)在为期10天的方案中向诱导型平滑肌细胞(iSMC)表型分化。在整个分化时间过程中进行蛋白质组学分析,以提供稳健且定义明确的起始和终止细胞群体。蛋白质组学数据验证了iPSCs向iSMCs的分化。与原发性人平滑肌细胞的蛋白质组学比较显示,iSMCs与之高度相关。iSMC分化后,我们通过将细胞在成骨培养基中培养17天,在iSMCs中启动了钙化过程。
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