多尺度心脏图像数据:小动物模型全心脏及其内部细胞结构成像

该数据集提供了小动物心脏的多尺度三维图像数据,包括通过微计算机断层扫描(micro-CT)获取的宏观心脏结构影像和通过扫描电子显微镜(SEM)获取的细胞超微结构影像,数据模态涵盖医学影像与显微图像,主要用于先天性心脏缺陷等疾病研究中关联心脏整体形态异常与细胞水平紊乱的多尺度分析与机制探索。

DataONE
2020-10-13 更新
浏览 28
心脏多尺度成像先天性心脏缺陷
Multiscale heart image data for: Multiscale cardiac imaging spanning the whole heart and its internal cellular architecture in a small animal model

基本信息

大小
0.000003647 GB
创建/更新时间
2020-10-13

资源简介

多尺度心脏图像数据:小动物模型全心脏及其内部细胞结构成像

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Multiscale heart image data for: Multiscale cardiac imaging spanning the whole heart and its internal cellular architecture in a small animal model》。

【数据内容】

源站原始描述:Cardiac pumping depends on the morphological structure of the heart, but also on its sub-cellular (ultrastructural) architecture, which enables cardiac contraction. In cases of congenital heart defects, localized ultrastructural disruptions that increase the risk of heart failure are only starting to be discovered. This is in part due to a lack of technologies that can image the three dimensional (3D) heart structure, assessing malformations; and its ultrastructure, assessing disruptions. We pre…

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256:85ede95ebdb793e1a5674cae1c58ff930317da9d46488cadb078a4d168ee3c54

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源站:https://search.dataone.org/view/sha256:85ede95ebdb793e1a5674cae1c58ff930317da9d46488cadb078a4d168ee3c54

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个多尺度心脏成像数据集,旨在通过关联成像技术同时获取心脏的整体形态和超微结构信息。数据集包含小动物(如小鼠)心脏的三维图像数据,其中宏观结构通过微计算机断层扫描(micro-CT)成像,而细胞水平的超微结构则通过扫描电子显微镜(SEM)获取。数据通过统一的样本固定和染色流程制备,确保在同一个样本上实现多尺度成像的关联性。该数据集主要用于先天性心脏缺陷等心脏疾病的研究,支持对心脏结构异常与细胞水平紊乱之间关联的探索,为心脏病理机制和疾病建模提供多尺度影像学基础。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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