新生儿先天性心脏缺陷（CHD）的表观遗传标记
该数据集包含新生儿先天性心脏缺陷（CHD）的表观遗传数据，主要涉及全基因组DNA甲基化分析，数据模态包括基因序列和甲基化水平信息。它通过比较60名CHD患者和32名对照新生儿的样本，揭示了胞嘧啶甲基化在大量基因中的显著差异，并展示了基于CpG基序甲基化的高诊断准确性模型，主要用于先天性心脏病的早期诊断、表观遗传机制探索和生物标志物开发研究。
创建时间2015-10-08
更新时间2016-03-25
原始链接
https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Epigenetic_markers_for_newborn_congenital_heart_defect_CHD_/1568139/1
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资源简介
该数据集旨在研究新生儿先天性心脏缺陷（CHD）的表观遗传标记，通过全基因组DNA甲基化分析，比较60名患有不同类型CHD（如左心发育不全综合征、室间隔缺损、房间隔缺损、肺动脉狭窄、主动脉缩窄和法洛四联症）的新生儿与32名对照新生儿的DNA样本。研究发现，所有CHD类别中，大量基因的胞嘧啶甲基化存在显著差异，基因本体分析显示涉及细胞发育、分化和解剖结构形态发生的生物过程过度表达。此外，基于CpG基序中特定胞嘧啶核苷酸水平的预测模型显示出高诊断准确性，例如对主动脉缩窄的检测灵敏度达100%，特异性为93.8%。数据集为开发新生儿CHD的准确遗传生物标志物提供了潜在基础，主要应用于先天性心脏病的早期诊断、表观遗传机制研究和生物标志物开发。
提供机构：Uppala Radhakrishna
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