新生儿先天性心脏缺陷（CHD）的表观遗传标记
该数据集包含新生儿先天性心脏缺陷（CHD）的表观遗传数据，主要涉及全基因组DNA甲基化分析，数据模态包括基因序列和甲基化水平信息。它通过比较60名CHD患者和32名对照新生儿的样本，揭示了胞嘧啶甲基化在大量基因中的显著差异，并展示了基于CpG基序甲基化的高诊断准确性模型，主要用于先天性心脏病的早期诊断、表观遗传机制探索和生物标志物开发研究。
基本信息
资源简介
新生儿先天性心脏缺陷（CHD）的表观遗传标记
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Epigenetic markers for newborn congenital heart defect (CHD)》。配套论文《Epigenetic markers for newborn congenital heart defect (CHD)》发表于 The Journal of Maternal-Fetal & Neonatal Medicine（2015），DOI：10.3109/14767058.2015.1069811。源站首次发布：2015-09-25。
【数据内容】
源站原始描述：Objective: Our objective was to determine whether there were significant differences in genome-wide DNA methylation in newborns with major congenital heart defect (CHD) compared to controls. We also evaluated methylation of cytosines in CpG motifs for the detection of these CHDs. Methods: Genome-wide DNA methylation analysis was performed on DNA from 60 newborns with various CHDs, including hypoplastic left heart syndrome, ventricular septal deficit, atrial septal defect, pulmonary stenosis, coa…
【数据结构与技术规格】
文件数 18 个，合计 993.01 KB。Supl Table 18 Epigenetic Markers in CHD May 23 2015.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，14.75 KB。Supl Table 5 Epigenetic Markers in CHD May 23 2015.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，17.68 KB。Supl Table 17 Epigenetic Markers in May 23 2015.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，14.13 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.1568139。
【主题与分类】
源站学科分类：Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Biological Sciences not elsewhere classified、Developmental Biology、Cancer。主题标签：gene ontology analysis、heart defect、DNA、AUC、CHD、atrial septal defect、CpG motifs、newborn、cytosine methylation。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Biological Sciences not elsewhere classified、Developmental Biology、Cancer。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Epigenetic_markers_for_newborn_congenital_heart_defect_CHD_/1568139
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Epigenetic markers for newborn congenital heart defect (CHD). Taylor & Francis. Bahado-Singh, Ray O.; Zaffra, Rita; Albayarak, Samet; Chelliah, Anushka; Bolinjkar, Rashmi; Turkoglu, Onur; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-30，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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数据说明
该数据集旨在研究新生儿先天性心脏缺陷（CHD）的表观遗传标记，通过全基因组DNA甲基化分析，比较60名患有不同类型CHD（如左心发育不全综合征、室间隔缺损、房间隔缺损、肺动脉狭窄、主动脉缩窄和法洛四联症）的新生儿与32名对照新生儿的DNA样本。研究发现，所有CHD类别中，大量基因的胞嘧啶甲基化存在显著差异，基因本体分析显示涉及细胞发育、分化和解剖结构形态发生的生物过程过度表达。此外，基于CpG基序中特定胞嘧啶核苷酸水平的预测模型显示出高诊断准确性，例如对主动脉缩窄的检测灵敏度达100%，特异性为93.8%。数据集为开发新生儿CHD的准确遗传生物标志物提供了潜在基础，主要应用于先天性心脏病的早期诊断、表观遗传机制研究和生物标志物开发。
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