糖尿病心肌病发病机制的多组学洞察:表观遗传与代谢谱

该数据集是一个整合了代谢组、转录组、蛋白质组和表观遗传组(ATAC-seq)的多模态小鼠模型研究数据,旨在系统揭示糖尿病心肌病的分子病理机制。数据内容具体包括心脏和血浆中的代谢物谱、基因表达谱、蛋白质丰度谱以及染色质可及性图谱,通过多组学关联分析发现了支链氨基酸和脂质代谢紊乱的关键调控网络,并识别出转录因子KLF15作为潜在的核心调控因子与治疗干预靶点,主要应用于心血管代谢疾病的机制研究与靶点发现。

Cai, Ziyang; Chen, Chen; Wuyun, Qidamugai; Zhou, Li; Ma, Xiaozhu; Yan, Jiangtao; Ding, Hu; Mei, ShuaiCai, Ziyang; Chen, Chen; Wuyun, Qidamugai; Zhou, Li; Ma, Xiaozhu; Yan, Jiangtao; Ding, Hu; Mei, Shuai
Taylor & Francis Group
2024-12-23 更新
浏览 31
Diabetic cardiomyopathymulti-omicsmetabolomicsepigenomicsATAC-seqRNA-seqBCAAs
Multi-omics insights into the pathogenesis of diabetic cardiomyopathy: epigenetic and metabolic profiles

基本信息

大小
0.019878528 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-12-23
版本
v1

资源简介

糖尿病心肌病发病机制的多组学洞察:表观遗传与代谢谱

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Multi-omics insights into the pathogenesis of diabetic cardiomyopathy: epigenetic and metabolic profiles》。配套论文《Multi-omics insights into the pathogenesis of diabetic cardiomyopathy: epigenetic and metabolic profiles》发表于 Epigenomics(2024),DOI:10.1080/17501911.2024.2435257。项目资助方:This manuscript was funded by the Hubei Key Research and Development Program [No. 2021BCA121], and the National Natural Science Foundation of China [Nos: 82170392 and 81974047].。源站首次发布:2024-12-03。

【数据内容】

源站原始描述:Diabetic cardiomyopathy (DbCM), a complex metabolic disease, greatly threatens human health due to therapeutic limitations. Multi-omics approaches facilitate the elucidation of its intrinsic pathological changes. Metabolomics, RNA-seq, proteomics, and assay of transposase-accessible chromatin (ATAC-seq) were utilized to elucidate multidimensional molecular alterations in DbCM. In the heart and plasma of mice with DbCM, metabolomic analysis demonstrated significant differences in branched-chain a…

【数据结构与技术规格】

文件数 7 个,合计 19.88 MB。FigureS2.tif:image/tiff,3.78 MB。FigureS3.tif:image/tiff,1.81 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.27950672.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Physiology、Environmental Sciences not elsewhere classified。主题标签:Diabetic cardiomyopathy、multi-omics、metabolomics、epigenomics、ATAC-seq、RNA-seq、BCAAs。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Physiology、Environmental Sciences not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Multi-omics_insights_into_the_pathogenesis_of_diabetic_cardiomyopathy_epigenetic_and_metabolic_profiles/27950672

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Multi-omics insights into the pathogenesis of diabetic cardiomyopathy: epigenetic and metabolic profiles. Taylor & Francis. Zhou, Li; Mei, Shuai; Ma, Xiaozhu; Wuyun, Qidamugai; Cai, Ziyang; Chen, Chen; et al

【使用注意】

· 源站最后修改于 2024-12-23,引用时请注意版本时效。

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数据说明

该数据集聚焦于糖尿病心肌病(DbCM)的病理机制研究,通过多组学整合分析揭示了疾病发生发展过程中的关键分子变化。数据集包含从小鼠模型获取的多维数据,具体涵盖:1)代谢组学数据,显示心脏和血浆中支链氨基酸(BCAAs)和脂质的显著差异;2)转录组(RNA-seq)和蛋白质组学数据,识别出BCKDHB、PPM1K、Cpt1b、Fabp4等与BCAAs和脂肪酸代谢紊乱相关的关键异常调控基因;3)表观遗传数据(ATAC-seq),揭示了染色质可及性的动态变化及其与基因表达模式的强正相关性,并识别出KLF15作为调控BCAAs代谢核心基因的关键转录因子。数据来源于对糖尿病心肌病小鼠模型的实验分析,主要应用于心血管代谢疾病机制研究、多组学数据整合分析、以及潜在治疗靶点(如KLF15)的发现与验证。

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