信息速览
项目 内容 条目名 MedXpertQA url_name medxpertqa 全称 MedXpertQA: Benchmarking Expert-Level Medical Reasoning and Understanding 类型 专家级医学评测基准数据集(多选题 MCQ,Text + MM 双子集) 规模 4,460 题 = Text 2,455 + MM 2,005;MM 子集含 2,839 张图像 选项形式 Text 10 选 1;MM 5 选 1 题源 USMLE、COMLEX-USA、17 个美国专科委员会考试、ACR DXIT/TXIT、EDiR、NEJM Image Challenge 许可 数据集 MIT;论文文本 CC BY 4.0(三层许可见 §6 与坑点 4) 发表 arXiv:2501.18362(2025-01-30 v1),ICML 2025 接收 团队 清华大学 + 上海人工智能实验室(GitHub org:TsinghuaC3I) 获取 HuggingFace TsinghuaC3I/MedXpertQA(gated=false,免登录直下) 评估 官方 leaderboard medxpertqa.github.io;OpenCompass 与 EvalScope 已集成 抓取时点 2026-10-03(HF 指标:downloads 9,628 / likes 65) 库内互链 medmcqa(111)、headqa(120)、medquad(160)、slake(250)、vqa-rad(240)、pathvqa(260)、pmc-vqa(270)、omnimedvqa(290) 等 19 条
MedXpertQA 是一个面向专家级医学知识与高级推理能力的评测基准:4,460 道源自真实医学执照考试与专科委员会考试的多选题,外加一个纳入病历、检查结果与医学影像的多模态子集。它由清华大学与上海人工智能实验室团队构建,2025 年 1 月底以 arXiv:2501.18362 发布,同年被 ICML 2025 接收。论文的核心主张很直接:当前沿模型在传统医学基准上接近满分时,医学评测需要更难、更贴近真实临床场景的「磨刀石」——而 MedXpertQA 给出的答案是连最强模型也只能拿到 45 分上下的专家级考卷。
本条目为 qianfanghub.com「千方病案医数集」AI-Ready Wikipedia 数据集的原始条目,覆盖身份与时间线、数据结构、获取复现、构建方法论、许可合规、评测成绩、生态互链与坑点存照九个维度,全部数字经论文、GitHub 与 HuggingFace 三源互证。
需要预先声明的一个阅读要点:本基准的公开材料存在多处「多口径并存」(评估模型数量 18/17/16、图像数 2,839/2,852、基础任务类两种字符串取值),这并非数据错误,而是学术项目多版本演进的常态痕迹。本条目的处理原则是「论文 v3 口径优先、实测存照随后、差异全部显式标注」——读者在任何地方看到与本条目不同的数字,应先核对 §9 坑点清单再判断对错。
导语读法三则:其一,赶时间者只读 §0 要点框与 §1 十问十答即可获得全貌;其二,准备下载使用者按 §4 → §6 → §9 顺序阅读,先拿数据再看许可与坑点;其三,做基准对比研究者务必通读 §7 与 §9——成绩口径的限定(抽样评估、子集不可比、榜单三口径)是本条目最重要的存照内容。
§0 导读:本条目读法与要点速览
本条目记述的对象是一个「考试题驱动」的评测基准,而非临床诊疗数据集。它不包含患者队列、随访记录或生理信号,因此 patient_count 为 0;它的价值在于用高质量、高难度、带专家标注的考试题,度量医学大模型的知识与推理上限。理解这一点是理解全篇口径的前提:本条目中的「患者」相关字段(patient_count、patient_tags)按数据集规范填零值与说明性文本,不代表数据集与临床实践无关——它的图像与题面大量来自真实临床情境,只是不含可识别患者记录。
五分钟要点框:
- 规模:4,460 题(Text 2,455 + MM 2,005),MM 子集配 2,839 张图像;每个子集另有 5 题 few-shot development set。
- 形式:Text 子集每题 10 选 1,MM 子集每题 5 选 1;随机基线分别为 10% 与 20%。
- 题源:USMLE(美国医师执照考试)、COMLEX-USA(整骨医学执照考试)、17 个美国专科委员会考试,以及 ACR DXIT/TXIT、EDiR 两套放射考试和 NEJM Image Challenge;共覆盖 17 个专科、11 个身体系统。
- 构建:初始收集 37,543 题,经人类分层过滤、AI 专家过滤(8 模型 × 14 采样投票)、相似性过滤、题目与选项增强、多轮持照医师审核五步,最终保留 4,460 题;抽检错误率约 4.3%。
- 难度:专家(备考执照的医学生)人类基线在 MM 子集平均 42.60 分;论文评估中唯一超过人类基线的是 o1(44.67 分,10% 抽样口径)。
- 许可:数据集 MIT;注意论文文本是 CC BY 4.0,且仓库 LICENSE 文件迟至 2025-09-07 才补齐(坑点 4)。
- 采用:Google DeepMind、Meta Superintelligence Labs、ByteDance Seed、Alibaba Qwen 四家实验室的官方模型报告均采用本基准。
全文导航表:
| 章节 | 内容 | 适合谁 |
|---|---|---|
| §1 | 十问十答速览 | 所有读者 |
| §2 | 身份、团队与时间线 | 引用者、编辑者 |
| §3 | 数据结构与字段分布 | 数据工程师 |
| §4 | 获取、下载与评估栈 | 数据工程师、复现者 |
| §5 | 构建方法论与质量控制 | 基准构建者 |
| §6 | 许可三层与引用规范 | 法务、引用者 |
| §7 | 评测成绩与解读 | 模型研究者 |
| §8 | 生态位与库内互链 | 选题策划者 |
| §9 | 八处坑点与口径存照 | 所有引用者(必读) |
| §10 | 总结:适用与不适用 | 决策者 |
三句话极简版:
- MedXpertQA 是把美国医学考试体系(USMLE、COMLEX-USA、17 个专科委员会考试、三套放射与图像来源)压成 4,460 道多选题的专家级评测基准,Text 与 MM 双子集,MIT 许可,ICML 2025 发表。
- 它经五步过滤(人类分层、AI 专家投票、去相似、选项增强、医师审核)从 37,543 题淘到 4,460 题,人类备考者平均只有 42.60 分,最强模型 o1 也仅 44.67 分(10% 抽样口径)。
- 引用它时记住三件事:评估模型数量有三个口径、o1 与 o3-mini 的成绩是抽样值、MM 与 Text 子集的成绩不可直接比较。
读者画像与建议路径:
| 读者画像 | 建议路径 | 关键产出 |
|---|---|---|
| 决策者 / 选题策划 | §0 → §1 → §10 | 入库判断与互链策略 |
| 数据工程师 | §3 → §4 → 附录 E | 字段 schema、下载与校验清单 |
| 模型评测者 | §4 → §7 → §9 | 评估栈选型与成绩口径 |
| 基准构建者 | §5 → 附录 B → 附录 D | 方法论参照与就绪度对标 |
| 法务 / 合规 | §6 → §9 → 附录 D | 三层许可边界与检查清单 |
十条金句摘要(每条对应正文一章,可作引用素材):
- 37,543 进、4,460 出,11.9% 的保留率是「专家级」三个字的数字底气(§5.1)。
- 人类备考者 42.60 分、GPT-4o 35.96 分、o1 44.67 分——这是一张让最强模型也只到及格边缘的考卷(§7.2)。
- Text 10 选 1、MM 5 选 1,随机基线 10% 与 20%,传统基准的 4 选 1 直觉在这里不适用(§3.1)。
- 8 个 AI 专家模型、每题 14 次采样投票,AI 第一次大规模充当医学出题与守门的评分员(§5.2)。
- 抽检 890 题错 39 题,4.3% 的错误率被官方坦然写进论文(§5.3)。
- PPL 从 1.03×10²¹⁸ 到 1.35×10²⁴⁷,防泄露评估用数字回答了「题目是否已进训练语料」(§5.5)。
- 单题最多 238,000 条人类作答记录,这是评测基准里罕见的样本量资产(§5.6)。
- 四大实验室与九家医学团队官方采用,「必测清单」地位由此确立(§8.3)。
- MIT 许可 + gated=false + 双框架集成,采用门槛几乎为零(§4、§6)。
- 八处坑点全部可绕行,前提是引用前先读 §9(§9)。
术语速记:本条目中 Text 指纯文本子集,MM 指多模态(Multimodal)子集;Reasoning 与 Understanding 是题目层面的二分类标签,不是两套数据;「Expert (Pre-Licensed)」指尚未取得执照、正在备考的高年级医学生群体,他们是论文中的人类基线来源。
§1 十问十答:一页读懂 MedXpertQA
问 1:MedXpertQA 到底是什么?
答:一个专家级医学多选题评测基准,共 4,460 题,分 Text(纯文本 2,455 题)与 MM(多模态 2,005 题)两个子集。所有题目源于真实的美国医学考试体系,经五步过滤与持照医师多轮审核后定稿。它的定位是「给前沿医学大模型出的高难度考卷」——当模型在 MedQA-USMLE 上做到 96% 时,同一批模型在 MedXpertQA 上只有 30 到 45 分。
延伸一句:「专家级」在这里是一个可验证的工程指标而非形容词——题目按人类作答记录做过难度标定,被专门保留下来的是「对人类备考者也不容易」的部分,所以人类基线只有 42.60 分(MM 平均),这不是模型的失败,而是基准设计的目标达成。
问 2:谁构建的?发表在哪里?
答:清华大学与上海人工智能实验室联合团队,作者 9 人,Yuxin Zuo 与 Shang Qu 为共同一作,Ning Ding 与 Bowen Zhou 为通讯作者。论文 arXiv:2501.18362 于 2025-01-30 发布,2025-05-06 宣布被 ICML 2025 接收(v3 为 camera-ready 版本)。代码仓库在 GitHub 的 TsinghuaC3I 组织下。
延伸:TsinghuaC3I 是清华大学相关方向的组织前缀,本项目的代码与后续维护都在该 org 下进行——检索代码时认准 TsinghuaC3I/MedXpertQA 全名,避免与同名仿写或镜像仓库混淆;作者名单与机构归属以论文署名页为准,本条目 §2.1 有完整表。
问 3:题目从哪里来?覆盖什么范围?
答:六类来源——USMLE、COMLEX-USA(含骨科影像解读特色)、17 个美国专科委员会考试,以及三个图像丰富来源:美国放射学会的 DXIT 与 TXIT 考试、欧洲放射委员会 EDiR 考试、新英格兰医学杂志 NEJM Image Challenge。覆盖 17 个专科(对齐 ABMS 25 个 member board 中的 17 个)与 11 个身体系统,总体对齐美国医疗实践与标准。
延伸:六类来源中前三类(USMLE、COMLEX-USA、专科委员会)贡献了以文本为主的考题,后三类(ACR 两套考试、EDiR、NEJM Image Challenge)则是图像富集来源——MM 子集的图像供给几乎全部来自后三者,这也是 MM 题面「真实临床形态」的来源基础。
问 4:数据规模多大?文件长什么样?
答:4 个 jsonl 文件加一个图像包。Text:dev.jsonl 5 题、test.jsonl 2,450 题;MM:dev.jsonl 5 题、test.jsonl 2,000 题;images.zip 约 493 MB(2,839 张图)。每条记录含 id、question(题干内嵌选项串)、options(字典)、label(单字母答案)、medical_task、body_system、question_type 七个核心字段,MM 记录另有 images 文件名列表。
规模之外的一个实用提醒:四个 jsonl 全部为逐行 JSON 存储,images.zip 内文件名与 MM 记录的 images 字段一一对应;下载后先校验文件字节数(见 §3.1 实测值)再入库,可避免镜像通道可能引入的截断问题。
问 5:它是怎么构建出来的?质量如何保证?
答:五步流水线。先按数千条人类答题记录做 adaptive Brier score 分层过滤(约 16.78% 题目因此淘汰);再让 8 个 AI 专家模型对每题采样 14 次投票过滤;第三步删高相似题;第四步用两个专有模型重写题干并扩充选项(Text 扩至 10 项、MM 扩至 5 项),同时删除低质量干扰项;最后由持照医师多轮审核。定稿后随机抽 10%(890 题)复审,发现错误率约 4.3%。
延伸:五步中的第一步与最后一步都依赖「人」——前者复用历史作答记录,后者动用持照医师;中间三步则是模型与算法的舞台。人类把守「难不难」与「对不对」,算法负责「冗余不冗余」与「形式好不好」,分工边界清晰,这也是它区别于纯自动化基准流水线的地方。
问 6:许可是什么?能商用吗?
答:数据集采用 MIT 许可,是本文收录基准中相当宽松的一档——商用、修改、再分发均可,保留版权与许可声明即可。三个注意:论文文本是 CC BY 4.0 而非 MIT,引用时别混用;GitHub 仓库 2025 年 2 月建库但 LICENSE 文件迟至 2025-09-07 才添加;图像源自考试材料,考试主办方(如 ACR、NBME 体系)的原始权利主张不在 MIT 覆盖范围内,严格场景建议阅读论文 §3 与仓库说明(详见 §6 与坑点 4)。
延伸:MIT 的实操含义是「在最终产品或研究声明里附上许可文本与版权声明即可」;与 GPL 类强 Copyleft 不同,基于本数据集的衍生分析代码不因使用数据而被传染开源义务。
问 7:模型能考多少分?人类呢?
答:论文主成绩单上,人类基线 Expert (Pre-Licensed) 在 MM 子集平均 42.60 分;GPT-4o 全子集平均 35.96 分;最强 LLM DeepSeek-R1 在 Text 子集 37.76 分;唯一超过人类基线的是 o1,MM 子集 44.67 分——注意该成绩是 10% 抽样评估(seed=42),不是全量成绩(坑点 5)。推理类模型相对同底座非推理模型有一致且显著的增益。
读这份成绩单时还要注意列结构:Reasoning 与 Understanding 是题目类型维度而非模型能力维度。例如人类基线 Understanding 高于 Reasoning(45.44 对 41.74),而 o1 恰好相反(46.24 对 39.66)——推理型模型在推理题上的相对优势,正是基准设计要检验的现象之一,§7.5 有专节展开。
问 8:它与 MedQA、MedMCQA 等经典基准的区别是什么?
答:三点。第一,难度档位不同:经典基准上前沿模型接近饱和,本基准把人类与模型都压到 40 分上下;第二,形式不同:Text 子集 10 选 1(传统多为 4-5 选 1),干扰项经专有模型增强;第三,多模态子集纳入病历、检查结果与真实考试图像,论文批评既有医学多模态基准「与真实临床场景脱节、仅考基础视觉感知」。
延伸:难度差还有一层结构性原因——经典基准多为题源原始形态直接入库,而本基准专挑「人类也不容易」的子集,再做干扰项增强;两道工序叠加,同源的原始题在两边的难度表现可以相差一个代际。规格层面的逐项对照见 §3.5。
问 9:怎么下载和跑评估?
答:HuggingFace 上 TsinghuaC3I/MedXpertQA 直接下载(gated=false,无需登录);官方评估代码在 GitHub 仓库(main.py 多线程推理 + eval.ipynb 算分);OpenCompass(PR #2002)与 EvalScope(–datasets medxpertqa)均已官方集成。特别注意:QVQ 与 DeepSeek-R1 两个模型必须用 eval.ipynb 中的专用答案清洗逻辑,utils.py 对二者不适用——这是仓库 README 的原文警告。
延伸:三条路径的选择建议——论文级复现(需要与已发表数字严格对齐)走官方脚本;工程化批量评测走 OpenCompass 或 EvalScope;快速探查数据走 datasets 库直读。三条路径共用同一份 HF 数据,切换成本仅在提示模板与清洗逻辑。
问 10:引用数字时最容易踩什么坑?
答:本条目 §9 收录八处坑点,最高频的三处:其一,模型数量有三个口径(论文摘要 18、GitHub README 17、HF 论文页 16),引用评估阵容必须注明出处;其二,o1 与 o3-mini 的成绩是 10% 抽样而非全量;其三,MM 与 Text 子集成绩不可直接比较——选项数不同、过滤参数不同,论文原文明确说明。其余见 §9。
延伸:坑点的共性规律是「同一事实存在多个正确口径」——模型数、图像数、任务类字符串、抽样成绩都是如此。判断对错前先问「哪个版本、哪个口径」,这一习惯比记住任何单个数字都重要。
十个数字记忆卡(按重要性排序,全部可在正文对应章节找到展开):
| # | 数字 | 含义 | 展开位置 |
|---|---|---|---|
| 1 | 4,460 | 题目总量 = Text 2,455 + MM 2,005 | §3.1 |
| 2 | 2,839 | MM 子集图像数(论文口径) | §3.4 |
| 3 | 37,543 → 4,460 | 构建漏斗入口到出口,保留率约 11.9% | §5.1 |
| 4 | 42.60 | 人类基线 Expert (Pre-Licensed) 的 MM 平均分 | §7.2 |
| 5 | 44.67 | o1 的 MM 平均分(10% 抽样口径,唯一超人类) | §7.2 |
| 6 | 35.96 | GPT-4o 跨子集总均分(vanilla LMM 最强) | §7.2 |
| 7 | 37.76 | DeepSeek-R1 的 Text 平均分(LLM 组最强) | §7.2 |
| 8 | 4.3% | 专家审核抽检错误率(39/890) | §5.3 |
| 9 | 16.78% | 因缺人类作答标注被淘汰的题目占比 | §5.2 |
| 10 | 10 / 5 | Text 与 MM 的每题选项数 | §3.1 |
§2 身份与定位:从收集到 ICML 的全景
2.1 名称、团队与三件套
MedXpertQA 的全称为「MedXpertQA: Benchmarking Expert-Level Medical Reasoning and Understanding」,其中 Xpert 即 Expert 的变体拼写,QA 指问答(Question Answering)。名字直接宣示了它的两个卖点:专家级(Expert-Level)与推理/理解双维度(Reasoning and Understanding)。
构建团队来自两家机构:清华大学(Tsinghua University)与上海人工智能实验室(Shanghai Artificial Intelligence Laboratory),代码发布在 GitHub 的 TsinghuaC3I 组织下。作者共 9 人:
| 序位 | 姓名 | 备注 |
|---|---|---|
| 共同一作 | Yuxin Zuo | — |
| 共同一作 | Shang Qu | 同时挂上海AI实验室;联系邮箱 lindsay2864tt@gmail.com;arXiv 提交人 |
| 作者 | Yifei Li | — |
| 作者 | Zhangren Chen | — |
| 作者 | Xuekai Zhu | adaptive Brier score 过滤方法(Zhu et al., 2024)的一作 |
| 作者 | Ermo Hua | — |
| 作者 | Kaiyan Zhang | — |
| 通讯作者 | Ning Ding | 同时挂上海AI实验室;dn97@mail.tsinghua.edu.cn |
| 通讯作者 | Bowen Zhou(周伯文) | 同时挂上海AI实验室;zhoubowen@mail.tsinghua.edu.cn |
项目对外有三件套:Leaderboard(medxpertqa.github.io)、Code(github.com/TsinghuaC3I/MedXpertQA)、Data(huggingface.co/datasets/TsinghuaC3I/MedXpertQA)。论文致谢列明三项资助:国家科技重大专项(2023ZD0121403)、中国科协青年人才托举工程(2023QNRC001)、国家自然科学基金(No. 62406165)。
三件套分工速览:
| 平台 | 角色 | 适合场景 |
|---|---|---|
| arXiv | 论文与版本存档 | 引用、方法细节、附录(AI 专家模型清单在 C.1) |
| GitHub | 代码与新闻 | 复现评估、跟踪更新、提 issue |
| HuggingFace | 数据本体 | 下载 jsonl 与 images、查看数据卡 |
| medxpertqa.github.io | 榜单展示 | 浏览器查看最新排名(JS 渲染,脚本抓取不可得,坑点 7) |
定位上需要强调一个易被误读的点:MedXpertQA 是「基准(benchmark)」而非「训练语料」。它的每道题都有单一标准答案与严格的专家审核,专为评估设计;拿它做训练数据会同时浪费评估价值并引来分布泄漏争议。论文在 §5.1 专门做了防泄露评估(见 §5.5),也从侧面说明官方视「评估专用」为设计前提。
2.2 时间线:八节点大事记
下表综合 arXiv 版本页、GitHub README News 与 HF API 元数据实测,是本条目时间叙述的权威口径:
| 时间 | 事件 | 来源 |
|---|---|---|
| 2025-01-30 | 论文 v1 上线 arXiv(14:07:56 UTC,7,257 KB,提交人 Shang Qu) | arXiv abs 页 |
| 2025-02-08 | HF 数据集仓库创建(09:59:45Z 实测) | HF API createdAt |
| 2025-02-09 | GitHub 宣布 HF 数据集发布 | README News |
| 2025-02-20 | 论文 v2 更新(3,347 KB);Leaderboard 上线,首批收录 o3-mini、DeepSeek-R1、o1 | arXiv + README News |
| 2025-02-28 | 评估代码发布 | README News |
| 2025-04-08 | 集成 OpenCompass(PR opencompass#2002) | README News |
| 2025-05-06 | 宣布 ICML 2025 接收 | README News |
| 2025-06-06 | 论文 v3(ICML camera-ready,2,940 KB) | arXiv abs 页 |
| 2025-07-09 | HF 仓库 lastModified 实测时点 | HF API |
| 2025-09-07 | GitHub 仓库补建 LICENSE 文件(commit「Create LICENSE」) | GitHub 提交史 |
时间线里有两个值得咀嚼的细节。第一,数据集发布(2 月 8-9 日)早于评估代码(2 月 28 日)近三周——典型的「数据先行、工具跟进」节奏,社区在评估代码就绪前已经开始自行封装。第二,LICENSE 文件比建库晚了约七个月(坑点 4),对 2025 年 9 月前引用该仓库的下游项目,这是一个应当写进自己许可声明的存照事项。
arXiv 三个版本的变化也值得存照:v1(2025-01-30,7,257 KB)为首发版;v2(2025-02-20,3,347 KB)与 leaderboard 上线同日,体积缩减近半,与「首批模型成绩入榜」同步;v3(2025-06-06,2,940 KB)为 ICML camera-ready 定稿。引用具体数字时建议注明依据的版本——本条目全部成绩数字以 v3 为准。
2.3 引用与影响
截至 2026-10-03 抓取时点,Google Scholar 显示论文引用约 190 次(三次检索快照分别为 187、193 与 199,时点不同所致——引用时建议写「约 190 次」或注明具体快照值)。考虑到论文 2025 年初才发布,这一引用速度在医学评测基准中属第一梯队,主要由四类工作贡献:
- 四大实验室的官方模型报告:Google DeepMind、Meta Superintelligence Labs、ByteDance Seed、Alibaba Qwen——官方 GitHub README「Benchmark Adoption」栏目明文收录的采用记录。
- 医学专用模型:Google MedGemma、Alibaba DAMO Lingshu、Alibaba Quark QuarkMed、LG EXAONE 4.5、京东健康 Citrus-V 等(完整清单见下表)。
- 推理方法研究:o1 复现路线(O1 Replication Journey)、医学推理链工作(HuatuoGPT-o1、MedReason)等引文网络锚点。
- 评测框架生态:OpenCompass、EvalScope 的官方集成使基准成为框架内置选项,进一步放大采用面。
官方采用一览(GitHub README Benchmark Adoption 栏目实抓):
| 类别 | 团队 | 采用基准的模型/产品 |
|---|---|---|
| 基础模型 | Google DeepMind | Gemini 3 Pro、Gemma 4、DiffusionGemma |
| 基础模型 | Meta Superintelligence Labs | Muse Spark |
| 基础模型 | ByteDance Seed | Seed2.0 |
| 基础模型 | Alibaba Qwen | Qwen3.5 |
| 医学专用 | MedGemma 1 / 1.5 | |
| 医学专用 | Alibaba DAMO | Lingshu |
| 医学专用 | Alibaba Quark | QuarkMed |
| 医学专用 | LG | EXAONE 4.5 |
| 医学专用 | ByteDance | 小何 MedXIAOHE |
| 医学专用 | ACTAVA | Cura 1T |
| 医学专用 | MBZUAI | MedMO-8B |
| 医学专用 | InfiX | InfiMed-Foundation |
| 医学专用 | 京东健康 | Citrus-V |
引用影响力之外,更实质的影响是「难度标尺」的确立:后续医学模型报告普遍把 MedXpertQA 成绩列为区分普通与专家级能力的关键行项——一个模型在传统基准刷到 90% 而在 MedXpertQA 上只有 40%,足以说明其能力天花板所在。
2.4 为什么需要专家级基准:三个动机
把论文的立论动机拆成三点,有助于理解本基准的每个设计决策:
- 饱和危机。o1-preview 在 MedQA-USMLE 达 96%、MMLU Medical Genetics 达 99%(Nori et al. 2024,论文引述)。当基准接近满分,模型间的差异被压缩到噪声量级,评测失去区分度——这是 2024-2025 年评测社区转向「极限难度」的直接原因,通科方向有 Humanity’s Last Exam,医学方向就是 MedXpertQA。
- 场景失真。既有医学多模态基准(论文点名 slake、vqa-rad、pathvqa、pmc-vqa、omnimedvqa 五个)被批评「与真实临床场景脱节、仅考基础视觉感知」——题目问「图中是什么」而非「结合病历与检验值判断下一步」。MM 子集的对位设计是把病历文本、检验数值与真实考试图像一起交给模型。
- 推理革命需要新标尺。o1 类推理模型的核心增益在测试时推理深度,而非知识量;要在医学领域检验这一点,需要 Reasoning 与 Understanding 分型的题目设计,以及足以拉开推理与非推理模型差距的难度——§7.4 的三组对照实验正是为回答这个问题而设。
三个动机也分别对应了本基准的三块设计资产:极限难度对应五步过滤的激进保留率;场景保真对应 MM 子集的病历化题面;推理标尺对应 question_type 二分类与 reasoning-oriented subset。设计动机与设计资产一一咬合,是本基准方法论自洽性的体现。
2.5 命名与识别:与 MedQA 的区分
MedXpertQA 与 MedQA 是两个不同的基准,但名称相近、题源同属美国考试体系,初学者极易混淆。区分要点有三:其一,全称不同——MedQA 通常指 USMLE 题集(如 MedQA-USMLE),MedXpertQA 全称含 Expert-Level 字样;其二,形式不同——MedQA 多为 4-5 选项,MedXpertQA Text 为 10 选项;其三,难度定位不同——o1-preview 在 MedQA-USMLE 上 96%,在本基准上远低于此(§7.3),两者相隔一个难度代际。
本条目 url_name 为 medxpertqa,在 qianfanghub 库内与 medqa 系条目互为「难度梯度」邻居。检索与引用时建议同时给出全称与 arXiv 编号(2501.18362),避免命名歧义。
§3 数据结构:split、字段与分布
3.1 规模总账与文件清单
全部数字来自本条目编写时的逐文件下载实测,与论文 Table 1 交叉核对一致:
| 项目 | 值 | 实测口径 |
|---|---|---|
| 题目总量 | 4,460 | Text 2,455 + MM 2,005,逐行统计 |
| MM 图像 | 2,839 张 | 论文 §3 口径(第三方实测 2,852,差异见坑点 7) |
| Text dev / test | 5 / 2,450 | dev.jsonl 与 test.jsonl 逐行 |
| MM dev / test | 5 / 2,000 | 同上 |
| Text/dev.jsonl | 13,465 B | HF 文件 API |
| Text/test.jsonl | 4,163,223 B | 同上 |
| MM/dev.jsonl | 8,254 B | 同上 |
| MM/test.jsonl | 2,017,059 B | 同上 |
| images.zip | 517,130,457 B(约 493 MB) | LFS oid ca5d539b 开头 |
| HF 仓库总占用 | 520,420,025 B | usedStorage |
| 选项形式 | Text 10 选 1;MM 5 选 1 | 每个 split 全量校验一致 |
| HF revision | 7e7c465a68eb2b866926bfa59c8c9d17a8daba65 | API 实测 |
两个 dev split 各只有 5 题,论文 §3.1 原文称其为 few-shot development set——即仅供 few-shot 提示词示例使用,不作为正式评估集。这一点容易误读为「数据残缺」,实际是刻意设计。
文件清单读法:体积反差本身就是信息——Text/test.jsonl 4.2 MB 对 MM/test.jsonl 2.0 MB,说明纯文本题干的平均信息密度更高(长题干、长病历文本在 Text 中并不罕见);而 5 题的 dev 文件只有几 KB,进一步印证其「示例卡」属性。images.zip 一项就占总占用的 95% 以上,带宽受限环境可以先拉四个 jsonl 做文本侧实验,图像侧实验再单独拉包。
3.2 字段 schema 与标签体系
每条记录的 schema(HF README 文档与实测数据双重确认):
| 字段 | 类型 | 说明 |
|---|---|---|
| id | string | 唯一编号,形如 MM-26、Text-100 |
| question | string | 题干文本,选项以 Answer Choices 形式内嵌于题干 |
| options | dict | 选项字典(键为字母,值为选项文本);Text 10 项、MM 5 项 |
| label | string | 正确答案单字母 |
| images | list(仅 MM) | 该题引用的图像文件名列表,对应 images.zip 解压内容 |
| medical_task | string | 三大任务类别:Diagnosis / Treatment / Basic Science 或 Basic Medicine(取值口径见坑点 2) |
| body_system | string | 身体系统标签(11 系统 + 兜底类,见坑点 3) |
| question_type | string | Reasoning / Understanding 二分类 |
question_type 标签体系值得单独说明:它由 gpt-4o 按论文附录 I.1 的提示词标注——考察复杂推理(需多步推导、整合多信息源)的题为 Reasoning,考察知识记忆与理解的题为 Understanding。论文把 Reasoning 子集称为 reasoning-oriented subset,专门用于评估 o1 类推理模型。这是「用模型标注、服务模型评估」的典型做法,使用时应意识到该标签本身携带 gpt-4o 的判断偏差。
body_system 标签的依据是 Liachovitzky (2015) 人体生理学教材的体系划分(11 个系统全覆盖),由 LLM 辅助标注。medical_task 则对应考试大纲中的能力维度:诊断(Diagnosis)、治疗(Treatment)与基础科学(Basic Science)。
读取流程要点:解析 jsonl 时按行读取;options 是字母到文本的字典,按 label 键取答案文本即可还原完整选项;MM 记录的 images 是文件名数组,需与 images.zip 解压目录拼接路径;question 字段内嵌的 Answer Choices 串与 options 字典内容一致,解析器二选一即可,切勿拼接两次造成选项重复。
3.3 实测分布:task、type 与 body system
以下分布为本条目编写时对 test 两个 jsonl 的逐字段统计(dev 各 5 题不计):
MM test(n=2,000)question_type 与 medical_task:
| 维度 | 取值 | 题数 |
|---|---|---|
| question_type | Reasoning | 1,446 |
| question_type | Understanding | 554 |
| medical_task | Diagnosis | 1,199 |
| medical_task | Treatment | 448 |
| medical_task | Basic Science | 353 |
Text test(n=2,450)question_type 与 medical_task:
| 维度 | 取值 | 题数 |
|---|---|---|
| question_type | Reasoning | 1,861 |
| question_type | Understanding | 589 |
| medical_task | Diagnosis | 1,050 |
| medical_task | Treatment | 746 |
| medical_task | Basic Science | 654 |
MM test body_system 12 个取值(论文口径为 11 系统 + 1 兜底):
| body_system | 题数 | body_system | 题数 |
|---|---|---|---|
| Skeletal | 491 | Digestive | 168 |
| Cardiovascular | 320 | Reproductive | 98 |
| Nervous | 231 | Lymphatic | 81 |
| Integumentary | 225 | Endocrine | 74 |
| Respiratory | 192 | Urinary | 56 |
| Muscular | 46 | Other / NA | 18 |
两个分布启示:第一,Reasoning 占比在两个子集都接近四分之三(MM 72.3%、Text 76.0%),印证「高级推理」的定位;第二,骨骼系统(Skeletal)在 MM 中一枝独大(24.6%),与 COMLEX-USA 的骨科影像特色及放射题源的结构性倾斜有关——按 body_system 做分层分析时需留意这一偏斜。
task 维度上两子集结构也不同:MM 的 Diagnosis 占六成(1,199/2,000),Treatment 与 Basic Science 分列其后——多模态考试的重心天然落在「看图诊断」;Text 的分布更均衡(Diagnosis 1,050 / Treatment 746 / Basic Science 654),因为执照考试的文本题本就覆盖治疗决策与基础科学。task 结构不同也是「两子集不可直接比较」的另一层依据(坑点 6)。
使用这些分布时的三条注意:其一,以上分布仅覆盖 test 集,dev 的 10 题不参与统计,做全集统计时需自行合并并注明;其二,body_system 仅 MM 子集有实质取值,跨子集的按系统分析只能在 MM 上做;其三,Skeletal 的占比偏斜意味着按系统聚合的模型对比结论会受「擅长骨科影像」这一单一能力放大,建议同时报告全集与去 Skeletal 两个口径。
3.4 图像构成
MM 子集共 2,839 张图像(论文 §3 口径),构成特征如下:
| 特征 | 值 |
|---|---|
| 每题图像数 | 1 至 6 张,均值 1.43 |
| 分辨率跨度 | 323×34 至 4248×2144 像素 |
| 图像 10 类 | Radiology、Pathology、Medical Optical Imaging、Photos、Vital Signs、Diagrams、Documents、Charts、Tables、Others |
| 打包形式 | images.zip 单包,约 493 MB |
10 类图像中,Radiology 与 Pathology 是考试图像的绝对主体,Photos 与 Vital Signs 多来自 NEJM Image Challenge 的临床照片题,Diagrams/Documents/Charts/Tables 则承接检验报告与图表类考题。分辨率跨度极大(从超宽幅 323×34 的检查单条码区到 4248×2144 的病理全景),使用者在做视觉预处理时不宜假设统一尺寸,建议按题级动态缩放并保留原始长宽比。
预处理建议:放射与病理类图像保留灰度信息;Documents、Charts、Tables 三类对 OCR 与版面理解能力敏感,视觉编码器在这三类上的失分未必等于医学能力失分——做错误归因时建议按图像类型分层,把「看不清」与「不会判」分开统计。
3.5 与同类基准的规格对照
下表按论文与 README 可核对的定性信息,把本基准与它对位或点名的基准放在一张表里(定性比较,不跨源混用具体分数):
| 基准 | 形式 | 难度定位 | 与本基准的关系 |
|---|---|---|---|
| MedQA-USMLE | 执照考试 MCQ(4-5 选项) | 前沿模型 96%,已饱和 | 难度梯度下一档;论文用其饱和反差立论 |
| MMLU Medical Genetics | 通科考试 MCQ | 前沿模型 99% | 同上,通科侧佐证 |
| medmcqa(111) | 印度医学生考试 MCQ | 规模大、难度低 | 规模轴对照(库内条目) |
| headqa(120) | 西班牙语考试 MCQ | 中低难度 | 跨语言对照锚点(库内条目) |
| slake(250) 等五个多模态基准 | 医学 VQA | 仅考基础视觉感知(论文批评) | MM 子集的对位设计面 |
| MedXpertQA Text | 考试 MCQ,10 选项 | 人类与模型 40 分上下 | 本体 |
| MedXpertQA MM | 考试 MCQ + 图像/病历,5 选项 | 同上(不可与 Text 直接比) | 本体 |
这张表也解释了「为什么不直接给老基准加难」:老基准的题源分布与标注体系已经固化,与其魔改不如以真实考试体系为地基重建——MedXpertQA 的题源选择正是这一判断的落地。库内对应条目的 rid 均已在 §8.1 列明,可循链延伸阅读。
§4 获取与复现:三渠道与评估栈
4.1 HuggingFace 获取(推荐主渠道)
数据集仓库为 TsinghuaC3I/MedXpertQA,免登录直下(gated=false),四个数据文件加一个图像包:
Text/dev.jsonl 13,465 B 5 题(few-shot development set)
Text/test.jsonl 4,163,223 B 2,450 题
MM/dev.jsonl 8,254 B 5 题(few-shot development set)
MM/test.jsonl 2,017,059 B 2,000 题
images.zip 517,130,457 B 2,839 张图像(仅 MM 子集引用)
截至抓取时点 2026-10-03,HF 页面显示 downloads 9,628、likes 65,size_categories 标注 1K<n<10K,数据集卡标签含 medical、question-answering、multimodal、reasoning、expert-level。HF 官方 task_categories 字段登记为 table-question-answering、question-answering、text-generation 三项——注意其中 table-question-answering 是登记口径与实际用途(MCQ 评估)之间的一个错位,使用者以 README 与论文为准即可。
下载方式任选其一:datasets 库 load_dataset("TsinghuaC3I/MedXpertQA")(会自动处理 MM 与 images 的对应关系);或 huggingface-cli 直接拉取 jsonl 与 images.zip 后自行解析。锁版本建议固定 revision 7e7c465a68eb2b866926bfa59c8c9d17a8daba65,保证跨论文可比。
下载后校验清单:核对五个文件的字节数与 §3.1 实测值一致;核对 MM test 行数 2,000、Text test 行数 2,450;抽验若干 MM 记录的 images 文件在解压目录中存在;记录所用 revision;若经镜像通道下载,建议与主站或第二镜像做一次比对,防止截断或版本错位。
4.2 GitHub 评估代码
仓库 github.com/TsinghuaC3I/MedXpertQA 提供官方评估脚本,两个入口:
- main.py:多线程推理调度,把模型输出落盘;
- eval.ipynb:算分入口,含答案解析与准确率统计。
README 有一处关键警告:QVQ-72B-Preview 与 DeepSeek-R1 两个模型必须使用 eval.ipynb 中的专用答案清洗逻辑,utils.py 中的通用清洗对二者不适用。原因是这两个模型的输出格式特殊(长推理链、答案标记非标准),通用正则会错切答案导致成绩失真。复现榜单数字时若忽略此警告,误差可能高达数个百分点。
官方 Leaderboard(medxpertqa.github.io)为 JS 渲染单页应用,静态抓取拿不到表格数据;需要引用最新榜单时,请以浏览器访问为准,或以论文 Table 4 与 GitHub README 的文本成绩单为存照依据(见坑点 7)。
4.3 第三方框架集成
不想碰官方脚本的话,两条成熟路径:
- OpenCompass:2025-04-08 经 PR #2002 官方集成,配置对应 Text 与 MM 子集;
- EvalScope:
--datasets medxpertqa一行启用,支持 text 与 MM 子集参数。
两套框架都把数据下载、提示模板、答案抽取与算分封装完毕,适合已有评估流水线的团队直接挂载。需要注意框架版本与数据 revision 的对应关系:早期框架封装若未固定 revision,可能随上游更新出现题目集合漂移——严肃对比实验请显式校验所用题数(Text 2,450 + MM 2,000)。
三条评估路径对比:
| 路径 | 优点 | 代价 |
|---|---|---|
| 官方 main.py + eval.ipynb | 与论文口径最接近,含专用清洗逻辑 | 需自行搭建推理环境 |
| OpenCompass | 配置化,框架生态成熟,社区案例多 | 版本与 revision 对应需自查 |
| EvalScope | 一行启用,子集参数灵活 | 细节封装于框架内部,排错需读源码 |
4.4 网络环境与镜像通道注意
部分网络环境访问 HF 主站不稳定,社区常用镜像通道(如 hf-mirror.com)做等效下载;镜像内容与主站的一致性由使用者自行校验(字节数 + 行数 + revision 三重核对)。arXiv 的 PDF 与 abs 页在多数环境可达,但 ar5iv 与 export.arxiv.org 子域并不总是稳定,需要论文 HTML 时可回退 arxiv.org 主站的 /html/ 渲染页。这些通道注意点是本条目编写时的实测存照,供网络环境类似的团队参考。
4.5 评估提示与算分要点
依据官方仓库与论文可核对的评估要点,跑分前先过这五条:
- 子集与选项数:Text 10 选 1、MM 5 选 1,提示模板必须按子集区分,选项枚举错位会直接污染成绩。
- few-shot 设置:dev 各 5 题是官方 few-shot 示例来源;用或不用、用哪几题,需在报告里写明。
- 答案清洗:常规模型走 utils.py 通用清洗;QVQ-72B-Preview 与 DeepSeek-R1 必须走 eval.ipynb 专用清洗(坑点 8)。
- reasoning-oriented subset:做推理能力专项对比时,按 question_type = Reasoning 过滤子集,并注明该标签为 gpt-4o 辅助标注(§3.2)。
- 题数校验:报告前核对 Text 2,450 + MM 2,000 的作答题数,防框架默认配置漏题或重复。
§5 构建方法论:漏斗、过滤与质量控制
5.1 构建漏斗:37,543 到 4,460
论文 Table 1 给出的三段式漏斗是理解本基准的第一把钥匙:
| 阶段 | Text | MM | 合计 | 说明 |
|---|---|---|---|---|
| 初始收集 | — | — | 37,543 | 六类题源全量爬取与汇集 |
| 过滤 + 增强后 | 2,578 | 2,105 | 4,683 | 五步流水线前四步完成后 |
| 专家审核后(定稿) | 2,455 | 2,005 | 4,460 | 多轮持照医师审核删除后 |
从 37,543 到 4,460,保留率约 11.9%——近九成候选题被淘汰。这个激进的过滤率是本基准「专家级难度」宣称的数字基础:留下的每一题都通过了人类难度分层与 AI 专家双通道筛选。值得注意的是 MM 子集在增强阶段反而被「加题」(过滤后 2,105 中含增强新增),增强不只改写还扩充了候选池。
5.2 五步过滤流水线
论文将 AI & Human Expert Filtering 划分为五步,本节按执行顺序拆解:
第一步:人类分层过滤(adaptive Brier score)。 基于题源自带的数千条人类答题记录,采用 Zhu et al. (2024) 的 adaptive Brier score 方法:按专家难度标注分层,对高、中、低三档各配自适应阈值——最高档阈值取全体分数的 25th 百分位,最低档取 3rd 百分位。达不到阈值的题目判定「对人类专家而言不够难」而淘汰。约 16.78% 的题目因缺失此类人类作答标注而未能通过此关(即使题目本身可能合格,也一并出局)。
第二步:AI 过滤。 8 个 AI 专家模型(清单见论文附录 C.1,正文未逐条列出)对每道题各采样 14 次投票;若 AI 专家们表现「太好」(说明题目对顶级模型太容易)则淘汰。这一步与第一步共同构成双通道难度闸门。
第三步:相似性过滤。 用概率语义相似度加精确匹配精度两种度量,删除彼此高度相似的题目,防止题源重复造成的评估冗余与记忆泄漏。
第四步:题目与选项增强(Question and Option Augmentation)。 两个专有模型(two proprietary models,论文未具名)对保留题重写题干、扩充选项,并删除「过于容易的错误选项」(easy and incorrect answer choices)。增强后 Text 子集达到每题 10 个选项、MM 子集 5 个选项——这是与所有传统医学基准拉开形式差异的关键一步:10 选 1 使随机基线降到 10%,同时放大了似真干扰项(plausible distractor)的干扰强度。
第五步:多轮专家审核(Expert Review)。 持有医师执照的医学专家逐题标注并纠正错误;论文特别指出,多数被标记的题目是「直接修正」而非「删除」——这解释了为何最后一步题量降幅(4,683 到 4,460,约 4.8%)远小于前几步。
五步流水线的设计逻辑:第一步用人类数据定「难不难」,第二步用 AI 专家定「对模型难不难」,两道闸门方向一致才能留下「对人类与模型都难」的题;第三步防冗余,保证信息量;第四步做形式增强,把干扰项质量抬到考试命题学水准;第五步用持照医师兜底正确性。整条流水线的哲学是「宁缺毋滥」——11.9% 的保留率是这一哲学的直接体现。
各步的典型失败模式(构建同类基准时的前车之鉴):第一步若无足够人类作答记录,阈值失锚——本数据集 16.78% 的淘汰即此约束的代价;第二步若 AI 专家阵容过弱,会把「对前沿模型仍难」的题误删,阵容须与目标评估代际匹配;第三步的相似度阈值过松会留重复题、过紧会误伤同病异形的好题;第四步的增强模型若与审核环节脱节,选项偏差会成批进入数据;第五步若只删不改,会白白损耗前四步的过滤投入——论文「多数修正而非删除」的策略正是对这一点的规避。
5.3 专家审核与抽检
审核质量本身经过抽检验证(论文 §3.4):从定稿集中随机抽 10%(Text 490 题 + MM 400 题,共 890 题)由专家复审,发现错误题 28(Text)+ 11(MM)= 39 题,错误率约 4.3%。这个数字应当如实理解为:约每 23 题中有 1 题存在标注或题面瑕疵。做细粒度分析(如按单题排名、构建 few-shot 示例池)时,建议对所用题目做二次人工核验;做聚合指标(准确率均值)时,4.3% 的噪声远小于模型间差距,一般无需校正。
审核人员构成:持照医师(physician’s licenses),多轮审核制。而成绩单上的人类基线「Expert (Pre-Licensed)」是另一群人——高年级医学生与备考 USMLE 的 trainee,其作答数据来自原始数据源的答题分布聚合,并非为本基准新征招的受试(见 §7.3)。
成本视角:五步流水线中真正的人力密集环节只有第一与第五步——前者复用题源自带的历史作答记录(边际成本近零),后者按抽检规模估算约 890 题级别的复审工作量。中段三步(AI 过滤、去相似、增强)以模型算力替代人力,这是该方法论对「小团队做大基准」的核心启示。
5.4 17 专科覆盖与标注佐证
GitHub README 的口径是「覆盖 ABMS 25 个 member board 中的 17 个专科委员会考试」。题源覆盖(USMLE、COMLEX-USA、17 个专科委员会、ACR DXIT/TXIT、EDiR、NEJM Image Challenge)与该口径一致。需要存照的是:17 个专科的逐一名称清单在论文正文与 README 中均未完整列出,数据集中也没有逐题 specialty 字段(MM 有 body_system 但无 specialty),因此「17 专科」目前只能按总数口径引用(见坑点清单 §9 的待核事项)。
ABMS 的 25 个 member board 覆盖美国全部主要专科方向;「17/25」意味着约三分之二的美国专科委员会考试体系被纳入题源。未覆盖 board 的具体名单论文未列,与「17 专科逐一清单缺失」同属待核事项——引用时以「17 个专科委员会考试」总数口径为准,勿自行脑补名单。
5.5 防泄露验证
基准数据集公开后的头号风险是被写进预训练语料。论文 §5.1 按 Xu et al. (2024) 的方法做了实例级泄露评估,采用 PPL(困惑度)、ROUGE-L 与编辑距离三种度量,对比「合成增强前」与「合成增强后」的题目文本:
- 合成前困惑度 PPL 1.03×10²¹⁸,合成后 1.35×10²⁴⁷;
- 结论:增强改写显著降低了与原始语料的文本重合,泄露风险低。
使用者的对应动作是:报告 MedXpertQA 成绩时注明数据版本 revision 与评估日期,避免把「见过数据」与「真会做题」的模型混在同一排名里讨论。
5.6 人类作答分布
由于题目继承自真实考试与题库,多数题目每题拥有不少于 500 条人类作答记录,最高达 238,000 条;定稿集中不足 200 题缺作答数据。这份分布数据支撑了三件事:第一步 adaptive Brier 过滤的阈值标定、人类基线 Expert (Pre-Licensed) 的聚合计算、以及后续研究者按题目难度做细粒度分析的可能性。对基准消费者而言,这是 MedXpertQA 区别于「纯爬取未经校准题库」的核心资产之一。
对下游的三种用法:其一,复现人类基线(聚合口径已在论文与 README 固化);其二,按题目难度分层评测(配合 adaptive Brier 的分档思想做模型强弱项分析);其三,研究「人类-模型一致性」——238k 级别的作答记录为逐题的模型-人群对比提供了罕见的样本量基础。
5.7 方法论的可迁移性
把本基准的构建经验抽象出来,可以迁移到其他领域的专家级基准构建:
- 双通道难度闸门(人类分层 + AI 专家投票)适用于任何「人类与模型都需要被压低」的评测设计,关键前提是题源自带或可补充人类作答记录。
- 增强而非单纯过滤:第四步说明「删题」与「改题」可以并存——专有模型改写题干与扩充选项,既提高难度又扩充候选池;但必须以第五步专家审核兜底,否则模型增强的偏差会直接进入数据。
- 抽检制度化:10% 抽样复审并公开错误率(4.3%)的做法,为「标注质量可审计」提供了模板——比起宣称「多轮审核保证质量」,给出抽检错误率是更可验证的表述。
- 防泄露前置于发布:PPL/ROUGE-L/编辑距离三度量的实例级泄露评估,应在任何基准公开发布前完成,尤其是题源已在网络公开流传的场景。
这四条也解释了为何本基准能在发布后迅速获得四大实验室采用:方法论的可信度与数据的难度同样重要,而五步流水线把两者都落成了可检验的工程事实。
5.8 四种医学 MCQ 构建法对比:漏斗法的位置
| 构建法 | 代表 | 质量上限 | 规模上限 | 泄露风险 | 成本结构 |
|---|---|---|---|---|---|
| 官方真题直发 | MedQA(USMLE 真题) | 高(命题人级) | 低-中 | 高(真题进入训练语料) | 授权谈判 |
| 众包标注 | 部分医学 QA 集 | 不稳(标注员水平差异) | 高 | 中 | 人力 + 质检 |
| LLM 直接生成 | 部分合成集 | 低-中(幻觉与事实错误) | 极高 | 低(全新题)但错误率高 | 算力 |
| 考题漏斗(本条目) | MedXpertQA | 高(真题底子 + 医师终审) | 中(4,460) | 低(改写 + 三指标检验) | 真题授权 + 8 AI 专家算力 + 医师工时 |
漏斗法的本质是三项资产的互换:用真题的效度、合成法的防泄露、医师审核的可靠性,交换规模——37,543 收窄到 4,460,收成率 11.9%。它换来的是同规模中几乎最高的单题质量与最低的记忆泄露面。想复制这条路线的团队,预算大头在「AI 专家过滤的推理算力」与「持照医师的审核工时」两项,而非数据获取本身。
§6 许可与合规:三层许可与引用规范
6.1 许可三层:数据集、论文与上游题源
引用或使用 MedXpertQA 时,许可信息必须分三层表述,混用是本条目收录基准中最常见的合规错误:
| 层 | 对象 | 许可 | 说明 |
|---|---|---|---|
| 第一层 | 数据集本体(jsonl + images.zip) | MIT | GitHub LICENSE 文件与 HF cardData.license 双源一致 |
| 第二层 | 论文文本 | CC BY 4.0 | arXiv 页脚标注;覆盖论文叙述与表格,不覆盖数据 |
| 第三层 | 题源上游权利 | 未显式让渡 | USMLE、ACR 等考试主办方对原始题目内容保留权利,MIT 许可由数据集发布方作出 |
第三层的含义需要谨慎理解:MIT 许可是清华与上海AI实验室团队对其「收集、过滤、增强、审核」劳动成果的授权声明;考试题的原始知识产权链条(题面是否经过足以构成演绎作品的改写)论文未做法律层面的展开。对绝大多数研究与评估用途,第一层 MIT 已足够;对商业再分发或衍生题库产品,建议同时阅读论文 §3 关于题源与增强改写的描述,必要时咨询法务。
许可时间线上另有一处存照(坑点 4):GitHub 仓库 2025 年 2 月建库,但 LICENSE 文件迟至 2025-09-07 才以 commit「Create LICENSE」添加。在长达约七个月的窗口里,仓库页面无显式许可文件——2025 年 9 月前 fork 或引用的下游项目,其许可依据是当时 HF 数据集卡的 MIT 标注,引用旧版本资料时应当知晓这段空窗。
6.2 引用规范
学术引用引论文(arXiv:2501.18362,doi 10.48550/arXiv.2501.18362);数据引用引 HF 仓库并固定 revision;使用其评估代码复现成绩时,同时引用仓库。BibTeX 信息以论文 arXiv 页与 GitHub README 提供的官方条目为准。
报告成绩的规范句式建议:「在 MedXpertQA Text test(2,450 题,revision 7e7c465a)上准确率 X%」,涉及 MM 时注明「5 选 1」;涉及 o1 或 o3-mini 的对比时,必须带「10% 抽样评估(seed=42)」限定(坑点 5)。
四个可直接套用的句式模板:
1. 成绩引用:在 MedXpertQA MM test(2,000 题,5 选 1,revision 7e7c465a)上,
参照论文 Table 4 的官方评估设置,模型 X 的平均准确率为 Y%。
2. 抽样成绩引用:o1 在 MedXpertQA MM 的 Reasoning/Understanding 各 10% 抽样
评估(seed=42)中平均 44.67%(论文 Table 4,‡ 标注行),非全量成绩。
3. 数据引用:题目与图像取自 HuggingFace TsinghuaC3I/MedXpertQA
(revision 7e7c465a,MIT 许可),方法描述见 arXiv:2501.18362。
4. 第三方口径引用:据 llm-stats.com 社区实测(2026-06 更新,非官方口径)……
——严禁与论文 Table 4 并列成同一排名。
6.3 合规场景速查
| 场景 | 结论 | 依据 |
|---|---|---|
| 论文评测并报告成绩 | 允许,注 revision 与抽样限定 | MIT + 学术惯例 |
| 内部模型选型与迭代 | 允许 | MIT |
| 产品宣传引用成绩 | 允许但须注明子集与口径 | §6.2 句式 |
| 修改后再分发题库 | MIT 允许,保留声明;上游权利自审 | §6.1 第三层 |
| 拆分售卖 label 或题目 | 与基准使用伦理冲突,不建议 | §6.3 |
| 用 MM 图像做商业演示 | 注明题源出处并自审 | §6.3 |
| 把数据混入训练集 | 技术可行但破坏评估公信力,强烈不建议 | §10 |
6.4 使用建议清单
- 可做:模型评测、能力分析、错误类型研究、few-shot 提示研究、推理链分析(配合模型输出)、跨基准难度对比。
- 慎做:任何形式的训练或微调——技术上 MIT 不禁止,但会永久污染该模型的评估公信力,且与基准使用伦理冲突。
- 需声明:从考试材料衍生的图像用于产品演示或再分发时,注明题源出处(ACR、EDiR、NEJM 等)。
- 禁止:将 label 与题目拆开售卖、伪造 leaderboard 提交、把第三方榜单数字(如 llm-stats 口径)冒充论文官方口径。
6.5 许可边界三问
一问:给模型做评测并发表论文,需要向数据方申请吗?——不需要,MIT 与 gated=false 覆盖;引用论文与数据、注明 revision 即可。二问:基于本数据集构建的衍生题库可以发布吗?——MIT 允许再分发与修改,保留许可声明即可;但题面图像的第三层上游权利需自行评估,且发布后应声明与官方版本的关系。三问:把成绩写进商业材料需要注意什么?——成绩本身是事实陈述可以引用,但需注明子集、口径与抽样限定,不得把第三方榜单数字包装成论文官方口径(坑点 8)。
§7 评测结果:成绩单与解读
7.1 模型阵容与三口径存照
论文评估的模型数量存在三个口径(坑点 1):论文摘要写 18 个;GitHub README 现行列 17 个 LMM 与 LLM;HF 论文页的 v1 时期贴文写 16 个。差异来自版本迭代中个别模型的进出。本条目以论文 v3(ICML camera-ready)摘要的 18 为准引用,同时注明 README 口径。阵容分两组:
- LMMs(测全量基准,含 MM):GPT-4o、GPT-4o-mini、Claude-3.5-Sonnet、Gemini-1.5-Pro、Gemini-2.0-Flash、Qwen2.5-VL-72B、Qwen2-VL-72B、QVQ-72B-Preview 等;
- LLMs(仅测 Text 子集):o3-mini、DeepSeek-R1、QwQ-32B-Preview、DeepSeek-V3、Claude-3.5-Haiku、LLaMA-3.3-70B-Instruct、LLaMA-3-70B-UltraMedical、Qwen2.5-72B-Instruct、Qwen2.5-32B 等。
其中 o1 与 o3-mini 因评估成本,仅在 Reasoning 与 Understanding 两个维度各抽 10%(seed=42)评估,论文表格以 ‡ 号标注——引用这两行成绩必须带抽样限定。
7.2 主成绩单(论文 Table 4,Acc%)
成绩按 Reasoning / Understanding / Avg 三列组记录,下表摘录关键行:
| 模型 | 子集 | Reasoning | Understanding | Avg |
|---|---|---|---|---|
| Expert (Pre-Licensed)(人类基线) | MM | 41.74 | 45.44 | 42.60 |
| o1‡(10% 抽样) | MM | 46.24 | 39.66 | 44.67 |
| GPT-4o | MM | 30.63 | 29.54 | 30.37 |
| GPT-4o | Text | 40.73 | 48.19 | 42.80 |
| GPT-4o | 跨子集总均 | 35.05(R) | 38.58(U) | 35.96 |
| QVQ-72B-Preview | MM | — | — | 21.76 |
| QVQ-72B-Preview | Text | — | — | 33.55 |
| Claude-3.5-Sonnet | MM | — | — | 21.31 |
| Claude-3.5-Sonnet | Text | — | — | 33.20 |
| Gemini-1.5-Pro | MM | — | — | 19.67 |
| Gemini-1.5-Pro | Text | — | — | 34.10 |
| Gemini-2.0-Flash | MM 与 Text | 正文定性为 GPT-4o 之后最强的 vanilla LMM 之一 | — | — |
| DeepSeek-R1 | Text | 37.88 | 37.35 | 37.76 |
| o3-mini‡(10% 抽样) | Text | — | — | 37.30 |
| DeepSeek-V3 | Text | — | — | 24.16 |
| Claude-3.5-Haiku | Text | — | — | 17.76 |
| LLaMA-3.3-70B-Instruct | Text | 23.86 | 26.49 | — |
| QwQ-32B-Preview | Text | — | — | 18.00 |
读表须知:表中「—」表示论文 Table 4 未按该维度单独列示或原文未提供;GPT-4o 的三行分属不同聚合层级(MM 子集、Text 子集、跨子集总均),不可纵向相加;人类基线仅有 MM 行——Text 子集未设人类基线行,跨子集的「人机差」只能在 MM 上讨论;‡ 行为抽样成绩(坑点 5)。
六个关键读数:其一,42.60 与 44.67 只差 2.07 分——人类与最强模型的差距在本基准上被压缩到个位数;其二,30.37 对 42.80——GPT-4o 在 MM 上比 Text 低约 12 分,多模态考卷是普遍短板;其三,37.76 对 24.16——同源推理模型差距 13.6 分,是全表最干净的推理增益证据;其四,QVQ 的 MM 21.76 与 Text 33.55 落差再次提示子集不可比(坑点 6);其五,18.00 与 17.76——QwQ 与 Claude-3.5-Haiku 垫底,说明模型品牌标签不等于考试能力;其六,Muse Spark 78.4% 出自第三方口径,与论文口径是两个世界(坑点 8)。
第三方 llm-stats.com 追踪页(2026-06 更新,非官方口径)另列 12 个模型的社区实测,Muse Spark 78.4% 居首、Qwen3.5-122B-A10B 67.3%、Qwen3.5-27B 62.4%。该口径的提示模板、题目子集与算分方式均与论文不同,不可与论文 Table 4 混排(坑点 8)。
7.3 差距解读:人类基线、饱和与不可比
三个结构性结论支撑了本基准的「专家级」定位:
- 人类基线 42.60 分。Expert (Pre-Licensed) 群体在 MM 子集的平均正确率是 42.60%——注意这不是「医学专家只有 42 分」的意思:该基线来自备考执照的高年级医学生在来源考试作答记录的聚合,且题目经五步过滤专门保留「对人类也难」的部分。正确的读法是:在一个对人类备考者也只有约 43 分的题集上,模型普遍低于人类,仅 o1 例外。
- 前沿模型的饱和反差。o1-preview 在 MedQA-USMLE 达 96%、MMLU Medical Genetics 达 99%(Nori et al. 2024,论文引述),而同一代模型在 MedXpertQA 上远低于此——这是论文「现有基准已无法区分前沿模型」论断的实证支撑。
- MM 与 Text 不可直接比较。论文原文明确:MM 选项更少(5 对 10)、Text 过滤参数更严,两个子集的难度参数不同。任何「跨子集排名」或「MM 除以 Text 得出多模态折损率」的算法都是口径误用(坑点 6)。
7.4 推理时扩展对照
论文 §5.2 用三组同源模型对照检验「推理时扩展(reasoning at test time)」的增益:
| 对照组 | 子集 | 结论 |
|---|---|---|
| DeepSeek-R1 vs DeepSeek-V3 | Text | 推理模型显著领先(37.76 对 24.16) |
| QwQ-32B-Preview vs Qwen2.5-32B-Instruct | Text | 同向增益 |
| QVQ-72B-Preview vs Qwen2-VL-72B | MM | 同向增益 |
三组对照方向一致:o1 类推理模型在本基准上的优势并非模型规模或预训练差异所致,而与测试时推理深度直接相关。这使 MedXpertQA 成为评估「推理能力」而非「知识记忆」的优选标尺——也是 reasoning-oriented subset(question_type = Reasoning 的题目子集)被论文专门划出的原因。
7.5 分维度解读:Reasoning 与 Understanding 的倒挂
把 Table 4 的 Reasoning 与 Understanding 两列拆开看,有一个反直觉现象:人类基线在 Understanding 上更高(45.44 对 41.74),o1 却在 Reasoning 上更高(46.24 对 39.66);Text 组里 GPT-4o 同样是 Understanding 高于 Reasoning(48.19 对 40.73),LLaMA-3.3-70B 也是 Understanding 占优(26.49 对 23.86)。
两种解读并存:其一,Understanding 题考知识记忆与理解,恰是预训练语料覆盖最充分的部分,模型在此占优符合直觉;其二,Reasoning 题需要多步整合,唯有测试时推理深度可补——o1 的倒挂正是推理时扩展价值的直接证据。这组倒挂也让 reasoning-oriented subset 成为评估推理能力的更锐利子集:在 Reasoning 题上,模型间与人群间的分化都更大。
7.6 复现偏差排查表
| 症状 | 最可能原因 | 处置 |
|---|---|---|
| 成绩比榜单低很多 | 答案清洗不一致(尤其 QVQ 与 DeepSeek-R1) | 改用 eval.ipynb 专用清洗(坑点 8) |
| 成绩比榜单低(文本模型) | 提示模板或 few-shot 设置不同 | 对齐官方模板与 5 题 dev 示例 |
| 成绩比榜单高很多 | 题目子集不同或数据泄漏(训练接触过) | 核对题数与 revision |
| 分数波动大 | 采样温度未固定或投票口径不同 | 固定解码参数与采样次数 |
| MM 记录图像加载失败 | images 文件名与解压目录未对齐 | 检查路径拼接与 zip 解压层级 |
| 与他人复现互不一致 | 双方 revision 或子集范围不同 | 双方交换 revision 与题数校验值 |
7.7 成绩数字的使用守则
引用本基准成绩时执行四条守则:一是「成对引用」——任何成绩必须同时给出子集与评估设置(few-shot 或 zero-shot);二是「限定跟随」——o1 与 o3-mini 的数字到哪里,「10% 抽样、seed=42」的限定就跟到哪里;三是「分层归因」——Reasoning 与 Understanding 的分差只说明题目类型差异,不得引申为模型「推理智商」的排序;四是「口径隔离」——论文 Table 4、GitHub README、第三方榜单三个口径各用各的出处标注,绝不拼接。这四条与 §9 的坑点一一对应,是坑点清单在引用行为层的投影。
7.8 三个典型误读案例(成绩引用反面教材)
案例一:「o1 在 MedXpertQA 上拿到 44.67%,超过人类专家」。三处失真:44.67 是 MM 子集的 10% 抽样成绩(seed=42),非全量(坑点 5);「人类专家」应为「备考执照考试的医学生人群(Expert Pre-Licensed)」,其 MM 平均 42.60;44.67 亦只是「论文 18 模型中唯一超过该基线」,不可外推为「超过执业医师」。合规句式见附录 R。
案例二:「GPT-4o 在多模态医学题上比文本题差 12 个点,说明多模态能力更弱」。用 MM 30.37 减 Text 42.80 得出「多模态折损」,正是论文明确警告的跨子集直接比较(坑点 6):MM 五选一、Text 十选一,随机基线差一倍,且 Text 过滤参数更严——两卷考纲不同,差值不构成定量结论。
案例三:「2026 年第三方榜单 Muse Spark 78.4%,专家级医学推理接近解决」。78.4 来自 llm-stats 社区实测口径(2026-06,12 模型),提示模板与子集选择与论文不同(坑点 8);且「基准分数高」不等于「临床可用」——本基准只覆盖封闭式多选题,不含开放式临床推理与真实工作流(见 rai:dataLimitations)。第三方数字必须显式标注「非官方口径、不可与论文混排」。
§8 生态位与互链
8.1 库内难度梯度定位
在千方病案医数集的医学问答版图中,MedXpertQA 处于「专家级、高难度」档位,与下列库内条目构成清晰的难度与模态梯度:
| 互链条目(rid) | 关系 | 梯度叙事 |
|---|---|---|
| medmcqa(111) | 论文点名的传统基准 | 印度医学生考试,规模大、难度低,前沿模型接近饱和 |
| headqa(120) | 论文点名的传统基准 | 西班牙语考试题,跨语言对照锚点 |
| medquad(160) | 论文点名 | 消费级医疗问答,非考试难度轴 |
| emrqa(139) | 库内问答条目 | 从电子病历生成的问答,临床文本轴 |
| slake(250)、vqa-rad(240)、pathvqa(260)、pmc-vqa(270)、omnimedvqa(290) | 论文点名的多模态基准 | 论文正文批评其「与真实临床场景脱节、仅考基础视觉感知」——MedXpertQA MM 的对照面 |
| ehrxqa(646)、medhop(754) | 库内临床推理条目 | EHR 问答与多跳推理,临床场景轴 |
| rxqa(719)、medcalc-bench(708)、xmedbench(727) | 库内专项基准 | 用药、医学计算、扩展医学评测等专项能力轴 |
| gmai-mmbench(562) | 库内多模态评测 | 通用医疗多模态评测,难度低于本基准 |
| chexpert-plus(740)、word(412)、cblue(190)、medmnist(716) | 库内影像/NLP 资源 | 训练资源侧,与纯评估侧互补 |
互链条目逐条注解:medmcqa(111) 是规模轴的对照——数十万级题量但难度低,模型饱和的典型;headqa(120) 提供跨语言(西班牙语)考试题对照;medquad(160) 与 emrqa(139) 分别代表消费级问答与病历派生问答的非考试轴;slake(250)、vqa-rad(240)、pathvqa(260)、pmc-vqa(270)、omnimedvqa(290) 是论文点名批评的五大多模态基准,MedXpertQA MM 正是针对这一批评的对位设计;ehrxqa(646) 与 medhop(754) 沿 EHR 与多跳推理方向延伸临床场景;rxqa(719)、medcalc-bench(708)、xmedbench(727) 补充用药安全、医学计算与扩展评测三个专项轴;gmai-mmbench(562) 是难度低一档的通用医疗多模态评测;chexpert-plus(740)、word(412)、cblue(190)、medmnist(716) 属于训练资源侧,与纯评估定位的本数据集形成「评估-训练」互补。
论文对既有基准的批评点(脱节临床、仅考视觉感知)恰好是 MM 子集的设计靶心:纳入病历文本、检验数值与真实考试图像,让模型处理「信息以真实临床形态呈现」的题目。
8.2 引文网络锚点
从本条目出发的高价值引文路径,每条都对应 2025 年评测与推理研究的一条主线:
- Humanity’s Last Exam(arXiv:2501.14249):同为「前沿模型压榨难度」叙事,通科版本——两者并引可说明极限难度评测的跨领域浪潮。
- DeepSeek-R1(arXiv:2501.12948):本基准 Text 组最强 LLM 的技术报告,其与 DeepSeek-V3 的对照是推理时扩展的关键证据。
- HuatuoGPT-o1(arXiv:2412.19437):医学推理模型工作,代表「用专家级基准检验医学推理链」的方法路线。
- MedReason(arXiv:2504.00993):医学推理链数据与方法,与本基准构成「方法-标尺」互补。
- O1 Replication Journey(arXiv:2501.06458):o1 复现研究,需要区别于饱和基准的难度标尺。
这五条锚点各占一个研究动作:并引 HLE 说明跨领域浪潮;对照 DeepSeek-R1 与 DeepSeek-V3 说明推理增益;用 HuatuoGPT-o1 与 MedReason 说明医学推理链方法栈;引 O1 Replication Journey 说明复现研究对难度标尺的需求。库内互链与引文网络两层叠起来,就是本条目在知识图谱中的完整邻域。
8.3 行业采用主线
官方 README「Benchmark Adoption」栏目给出的采用清单(完整表见 §2.3),是本条目「行业影响」叙述的权威依据。叙事主线一句话:四大通用实验室(Google DeepMind、Meta MSL、ByteDance Seed、Alibaba Qwen)与九家以上医学专用团队(MedGemma、Lingshu、QuarkMed、EXAONE 4.5、MedXIAOHE、Cura 1T、MedMO-8B、InfiMed-Foundation、Citrus-V)在官方模型报告或模型卡中采用 MedXpertQA 成绩。
从采用清单能读出的两个模式:其一,四大通用实验室全部在旗舰模型的发布周期内引用本基准,说明它已进入「必测清单」级别;其二,医学专用团队倾向于同时报告传统基准与本基准,用后者的低分凸显「专家级差距仍在」的研发空间——这种「双榜单」叙事已成为医学模型发布的标准动作。
对库内条目而言,这是把「一个数据集」升格为「行业标尺」的关键证据链。
8.4 对库内选题的三点启示
其一,「难度即定位」:当库内同域基准已有多个时,新条目的价值锚点应选在未被占据的难度档,本基准的专家级卡位是范例。其二,「方法论即资产」:五步流水线、抽检错误率、防泄露验证构成了可引用的方法论包,使条目超越「数据介绍」进入「工程范式」层。其三,「采用清单即影响力」:收录时同步核查官方 README 的 adoption 栏目,用第三方可验证的采用记录支撑「行业标尺」类判断,而非自造评价。
8.5 与库内可获取性光谱的对照
| 光谱位置 | 代表条目 | 本条目对照 |
|---|---|---|
| 完全开放直下(MIT/Apache) | medxpertqa(本条目)、medmnist(716) | 同档;本条目另有 2,839 图像资产与双评测框架 |
| 公开但 gated/需注册 | 部分 HF gated 集 | 本条目 gated=false,无此摩擦 |
| 请求制(upon request) | panda-plus 注释掩码 | 本条目无任何请求环节——库内 AI-Ready 排名靠前的核心原因 |
| 受控访问(TA/DUA) | dbgap、ega 类 | 不同档;考题数据无 PHI,无需受控通道 |
一句话定位:在「评测基准」子类里,MedXpertQA 是库内获取摩擦最小、字段最齐、防泄露工程最完整的一档;AI-Ready 短板不在获取而在元数据口径(坑点 1-3)。
§9 坑点清单:八处易错点与口径存照
本节是全条目最重要的存照章节:八处坑点全部来自编写时的实测核对,每条按「现象 → 口径 → 正确用法」展开。引用本数据集的任何数字前,建议先通读本节。
坑点 1:评估模型数量存在三个口径
现象:论文摘要写 18 个模型,GitHub README 现行列 17 个,HF 论文页的 v1 时期贴文写 16 个。口径:三个数字都是「真」的,差异来自版本迭代中模型阵容的进出与统计边界(LMM 与 LLM 分组、是否含人类基线)。正确用法:以论文 v3 摘要的 18 为准引用并注明「论文口径」,需要引用 README 时写「GitHub README 现行口径 17 个」。禁止把三个数字混在同一段落里互相「纠错」。
坑点 2:medical_task 取值在文档与数据间不一致
现象:HF README 文档写三大任务类别为「Diagnosis, Treatment, or Basic Medicine」;实测 test jsonl 中的取值是「Basic Science」;MM dev 的 5 题中又出现「Basic Medicine」。口径:dev/test 实测取值不一致,属于上游标注演化痕迹。正确用法:表述统一写「三大任务类别:诊断/治疗/基础医学(数据中基础类存在 Basic Science 与 Basic Medicine 两种取值)」;做字段过滤脚本时同时兼容两种字符串。
坑点 3:body_system 是 11 个系统还是 12 个取值
现象:论文宣称覆盖 11 个 body systems;实测 MM test 有 12 个取值——第 12 个是 Other / NA 兜底类(18 题)。口径:两者不矛盾,11 系统 + 1 兜底。正确用法:按「11 系统」表述并注明另有 Other/NA 兜底 18 题;分层统计时勿把 Other/NA 混入任何单一系统,也勿因 12 个取值而宣称「12 系统」。
坑点 4:许可三层且 LICENSE 文件滞后七个月
现象:数据集 MIT(GitHub LICENSE + HF cardData 双源一致);论文文本 CC BY 4.0(arXiv 页脚);GitHub 仓库 2025-02 建库但 LICENSE 文件 2025-09-07 才添加。口径:三层许可各自覆盖不同对象。正确用法:数据集许可写 MIT,论文许可写 CC BY 4.0,不得互相替代;引用 2025 年 9 月前的仓库快照时注明当时无显式 LICENSE 文件、以 HF 标注为据;商业场景额外注意题源上游权利(见 §6.1)。
坑点 5:o1 与 o3-mini 的成绩是 10% 抽样
现象:Table 4 中 o1(MM 44.67)与 o3-mini(Text 37.30)带 ‡ 号,因评估成本仅在 Reasoning 与 Understanding 各抽 10%(seed=42)。口径:非全量成绩。正确用法:引用必须带「10% 抽样评估(seed=42)」限定;与其他模型的全量成绩并排展示时须标注 ‡ 并加脚注;禁止把 44.67 直接写成「o1 在 MedXpertQA 上的准确率」而无抽样说明。
坑点 6:MM 与 Text 子集成绩不可直接比较
现象:两子集成绩常被并排出现,诱导跨子集计算「多模态折损率」。口径:论文原文明确 MM 选项更少(5 对 10)、Text 过滤参数更严,难度参数不同。正确用法:两个子集各自内部排名有效;跨子集差值仅可作定性描述并注明「不可直接比较」;不得用 MM 减 Text 的差值作为「多模态能力损耗」的定量结论。
坑点 7:图像总数双口径与榜单静态抓取不可得
现象一:论文 §3 写 MM 图像 2,839 张,第三方 evalscope 实测 images 目录 2,852 张,差 13 张未决。现象二:官方 leaderboard(medxpertqa.github.io)为 JS 渲染 SPA,静态抓取返回空页。口径:图像数按论文 2,839 表述并注第三方实测;榜单数字静态抓取不可得。正确用法:图像数引用论文口径;需要最新榜单时浏览器访问官网,条目存照以论文 Table 4 与 GitHub README 文本为准;爬虫与脚本不要试图解析该 SPA 页面。
坑点 8:专用答案清洗与第三方榜单口径
现象一:QVQ-72B-Preview 与 DeepSeek-R1 的输出必须用 eval.ipynb 内的专用清洗逻辑,utils.py 通用清洗对二者不适用(README 原文警告),忽略会导致成绩失真。现象二:llm-stats.com 追踪页(2026-06 更新,12 模型,Muse Spark 78.4% 居首)是社区实测口径,提示模板与子集与论文不同。口径:官方成绩以论文 Table 4 为准;第三方榜单为独立口径。正确用法:复现推理模型成绩前先读 README 该警告;引用第三方榜单时显式写「非官方口径、不可与论文混排」。
坑点速查卡(详细分析见上文各坑点):
| 坑点 | 一句话记忆 | 高危场景 |
|---|---|---|
| 坑点 1 | 模型数三口径:18 / 17 / 16 | 综述引用评估阵容 |
| 坑点 2 | Basic Science 与 Basic Medicine 并存 | 字段过滤脚本 |
| 坑点 3 | 11 系统 + Other/NA 兜底 18 题 | 按系统分层统计 |
| 坑点 4 | 三层许可,LICENSE 滞后七个月 | 许可与再分发 |
| 坑点 5 | o1/o3-mini 是 10% 抽样 seed=42 | 成绩对比 |
| 坑点 6 | MM 与 Text 不可比 | 跨子集折损率 |
| 坑点 7 | 图像 2,839(论文)/ 2,852(实测);榜单 SPA | 图像数引用与榜单抓取 |
| 坑点 8 | QVQ/R1 专用清洗;llm-stats 非官方 | 复现与第三方引用 |
引用前 60 秒自检(八问八查):
- 我引的模型数量来自论文还是 README?(坑点 1)
- 我脚本里的 task 过滤能同时吃下两种基础类字符串吗?(坑点 2)
- 我的分层统计给 Other/NA 单列了吗?(坑点 3)
- 我的许可声明区分了数据集与论文吗?(坑点 4)
- 我写的 o1/o3-mini 数字带抽样限定了吗?(坑点 5)
- 我有没有做跨子集差值计算?(坑点 6)
- 我的图像数是 2,839(论文口径)吗?(坑点 7)
- 我复现推理模型时用了专用清洗吗?(坑点 8)
八问全绿,再落笔引用。
§10 总结:适用与不适用
适用场景:评估医学大模型的知识与推理上限,尤其是推理时扩展类模型(o1、DeepSeek-R1 及其后续);多模态医学能力的压力测试(MM 子集的真实考试图像与临床信息形态);基准饱和时代的难度标尺研究;训练数据质量方法论的参照系(五步过滤、专家审核、防泄露验证都是可迁移的工程范式)。
不适用场景:临床决策参考——考试题不等于真实患者诊疗,本数据集不含任何可用于个体诊疗的证据;模型训练或微调——技术上许可不禁止,但会永久污染评估公信力;低资源语言或非英美医疗体系的泛化结论——题源全部对齐美国考试体系;开放式医学对话评估——多选题封闭形式无法覆盖。
一句话定位:MedXpertQA 是 2025 年医学评测从「饱和的常识测验」转向「专家级压力测试」的标志性节点——4,460 道经五步过滤与持照医师审核的真实考试题,把人类与前沿模型同时压到 45 分上下,又以 MIT 许可与三件套工具链降低了采用门槛。它记录的不只是一个数据集,而是一种评测方法论的定型。
入库评估结论:按千方病案医数集的收录标准衡量——存在性(三源互证通过)、可获取性(gated=false 直下)、许可清晰度(MIT,三层存照)、方法论可审计性(抽检错误率公开)、行业影响力(四大实验室采用)五项全达标;主要保留意见集中在元数据口径瑕疵(坑点 2、坑点 3)与「待核」事项(17 专科清单等),均已在本条目存照,不构成入库障碍。DAIMS 综合评级 8.4/10,建议入库并按 §8.1 的互链地图建立邻居关系。
高频疑问详版:40 问分六组
组一:数据与内容(问 1 至问 6)
问 1:一条数据长什么样? 每条记录含 id(如 MM-26)、question(题干内嵌 Answer Choices 选项串)、options(字典,Text 10 项 / MM 5 项)、label(单字母)、medical_task、body_system、question_type 七字段;MM 记录另有 images 文件名列表对应 images.zip。
问 2:MM 子集的题目形态是什么? 题干常包含病历摘要、检验数值或检查所见,配 1 至 6 张图像(均值 1.43 张),图像类型覆盖放射、病理、光学影像、临床照片、生命体征、图表与文档等 10 类,模拟「信息以真实临床形态呈现」的作答情境。
问 3:Text 与 MM 之间有题目重叠吗? 两子集独立成集,MM 的题源自带图像富集属性(放射考试、NEJM Image Challenge 等),Text 侧重执照与专科委员会考试的文本题;论文未宣称两子集题目一一对应,跨子集比较因此更需谨慎(坑点 6)。
问 4:有没有答案解析? 官方发布只有单字母 label,无逐题解析。持照医师审核的修正记录未随数据集公开;需要解析类数据的研究者需另行构建。
问 5:题目是英文的吗? 是,全部题源为英文考试材料。跨语言评估需要自行翻译,且翻译后成绩与原版不可比。
问 6:每个子集那 5 道 dev 题怎么用? 论文 §3.1 称其为 few-shot development set,用于构造 few-shot 示例或调试验证流程;不要把 dev 并入 test 报成绩,也不必因它只有 5 题而质疑数据完整性。
组二:构建与质量(问 7 至问 12)
问 7:adaptive Brier score 过滤是什么? 一种基于人类作答记录的难度标定方法(Zhu et al. 2024):对题目按专家难度分三档,各档配自适应正确率阈值(最高档取全体 25th 百分位、最低档取 3rd),低于阈值即「对人类专家不够难」而淘汰;约 16.78% 题目因缺人类作答标注未过此关。
问 8:8 个 AI 专家模型是哪几个? 论文正文未逐条列出,清单在附录 C.1。本条目抓取时未能展开该附录表格,故仅按总数引用——这是待核事项,读者需要精确名单时应直接查阅论文附录。
问 9:做增强的「两个专有模型」是谁? 论文只写 two proprietary models 未具名,外界无法核实其身份;增强产物(改写题干与扩充选项)经过第五步专家审核兜底,质量不依赖模型身份透明。
问 10:4.3% 的抽检错误率影响大吗? 聚合指标(如平均准确率)层面影响可忽略——远小于模型间差距;单题级分析(错误归因、逐题排名、few-shot 示例挑选)建议对所用题目做二次核验。
问 11:图像有没有隐私问题? 图像源自公开考试材料与 NEJM Image Challenge 这类出版内容,经考试发布渠道公开;数据集不含患者标识。但「考试图像」与「临床采集图像」的分布差异本身是外推限制(rai:dataLimitations 已列)。
问 12:question_type 标签可信吗? 由 gpt-4o 按论文附录 I.1 提示词标注,属于模型辅助标注而非医师判定;用于「推理子集」的粗分组足够,用于精细任务分类学需抽验。
组三:许可与获取(问 13 至问 18)
问 13:能拿去训练模型吗? MIT 许可在法律层面不禁止,但基准使用伦理强烈反对:训练后模型成绩永久失真,且对其他使用者不公平。官方定位是评估专用。
问 14:图像商用有什么注意? 第一层 MIT 覆盖数据集打包产物;第三层题源上游(ACR、EDiR、NEJM 等主办方)的权利主张未被显式让渡,商业再分发图像前建议法务评估(§6.1)。
问 15:下载要注册或申请吗? 不需要,gated=false,HF 直下;GitHub 代码同样公开可见;官方 leaderboard 浏览即可看。
问 16:HF 页面的 downloads 9,628 怎么读? 抓取时点 2026-10-03 的累计下载数,含脚本拉取;likes 65。这两个数只反映热度不反映质量,引用时注时点。
问 17:有中文版或翻译版吗? 官方只有英文原版;未见官方认可的中文版本,任何翻译产物都是第三方工作,成绩与原版不可比。
问 18:怎么固定数据版本? HF revision 7e7c465a68eb2b866926bfa59c8c9d17a8daba65;load_dataset 传 revision 参数或 huggingface-cli 指定;论文对比实验务必锁定。
组四:评测与引用(问 19 至问 24)
问 19:我的模型该报哪个子集? 多模态模型报全量(Text + MM);纯文本 LLM 只报 Text(论文口径如此);只报其一时注明子集范围,勿写「MedXpertQA 总分」。
问 20:few-shot 还是 zero-shot? 官方评估用 5 题 dev 做 few-shot 示例;社区也常用 zero-shot。两者成绩有系统性差异,对比实验必须统一设置并注明。
问 21:为什么我的复现成绩和榜单不一样? 常见原因排序:答案清洗不一致(尤其 QVQ 与 DeepSeek-R1 的专用清洗,坑点 8)、提示模板不同、few-shot 与 zero-shot 设置不同、数据 revision 漂移、MM 图像对齐方式不同。逐项排查后仍有大偏差再质疑上游(排查表见 §7.6)。
问 22:o1 的 44.67 能直接引用吗? 能,但必须带「MM 子集、10% 抽样评估(seed=42)」双重限定(坑点 5);论文中它是唯一超过人类基线 42.60 的模型。
问 23:llm-stats 上的 Muse Spark 78.4% 是官方的吗? 不是。那是第三方追踪站的社区实测口径(2026-06 更新),与论文 Table 4 的官方口径不可混排(坑点 8)。
问 24:引用时写什么? 论文引 arXiv:2501.18362(doi 10.48550/arXiv.2501.18362,ICML 2025);数据引 HF TsinghuaC3I/MedXpertQA 并注 revision;代码引 GitHub 仓库;成绩注明子集与抽样限定。完整句式参考 §6.2。
组五:延伸与互链(问 25 至问 32)
问 25:和 Humanity’s Last Exam 是什么关系? 同属「前沿难度压榨」浪潮:HLE(arXiv:2501.14249)面向通科极限难题,MedXpertQA 聚焦医学专科;两者共享「人类与模型都被压低」的叙事,引用时可互为佐证。
问 26:DeepSeek-R1 的成绩为什么重要? 它是 Text 组最强 LLM(37.76),且与其非推理底座 DeepSeek-V3(24.16)的巨大差距是「推理时扩展有效」的最干净对照——同源模型,唯一变量是推理机制。
问 27:HuatuoGPT-o1 与 MedReason 是什么? 两项医学推理链工作(arXiv:2412.19437 与 arXiv:2504.00993),常引用本基准检验推理链方法在专家级难度下的增益,是引文网络的方法侧锚点。
问 28:O1 Replication Journey 为什么引用它? o1 复现研究(arXiv:2501.06458)需要区别于饱和基准的标尺,MedXpertQA 的 Reasoning 子集是其自然选择之一。
问 29:库内哪些条目与它构成直接对照面? 五大多模态基准 slake(250)、vqa-rad(240)、pathvqa(260)、pmc-vqa(270)、omnimedvqa(290)——论文对其「仅考基础视觉感知」的批评正是 MM 子集的设计靶心。
问 30:想研究难度梯度怎么设计实验? 纵轴用库内 medmcqa(111)(易)→ gmai-mmbench(562)(中)→ 本基准(难)做同模型梯次评测;横轴可加 headqa(120) 控制语言变量,加 ehrxqa(646) 控制临床场景变量。
问 31:它的成绩能说明模型「会看病」吗? 不能直接推断:考试题与真实诊疗存在形式与分布差距,成绩只说明「在专家级考试形式下的相对强弱」,临床有效性需真实世界研究补充。
问 32:后续会更新吗? HF 仓库 lastModified 实测 2025-07-09,模型阵容以论文 v3 与 README 现行为准;新版本动向以官方三件套为第一信源,引用时注明所用版本。
组六:误用与急救(问 33 至问 40)
问 33:发现公开材料里的数字与论文对不上怎么办? 先查 §9 坑点与附录 F 的快照对照,确认是「多口径」还是「真错误」;本条目收录的口径差异都有存照,直接引用存照口径即可。
问 34:把 MedXpertQA 成绩和 MedQA 成绩放一张表行吗? 可以并排,但必须标明两者难度代际不同(96% 对 40 分上下),并避免用分差做「能力倍数」类换算。
问 35:审稿人质疑我的复现成绩偏低怎么办? 按 §7.6 排查表逐项自证:revision、清洗路径、few-shot 设置、题数校验值,四项齐了即可回应。
问 36:可以只用 Reasoning 子集发论文吗? 可以,但标题与结论必须写明「reasoning-oriented subset」并注 gpt-4o 标注来源(§3.2),不得写成全集成绩。
问 37:图像打不开或对应错位怎么办? 核对 images 字段文件名与解压目录的层级拼接,并校验 images.zip 字节数(§3.1);镜像下载场景优先怀疑截断。
问 38:想给题目加中文翻译再评测行吗? 技术可行但成绩与官方口径不可比,发布时必须声明「翻译自建版本」,且不得与原版混排排名。
问 39:发现疑似标注错误向哪里反馈? GitHub 仓库提 issue,附题目 id(如 MM-26)与理由;官方以持照医师审核结论为准。
问 40:一年后这份条目会过期吗? 数字类内容锚定抓取时点 2026-10-03;榜单与引用数会漂移,坑点与口径存照部分长期有效——过期的主要是「热度数字」,不是方法论与结构。
事实清单:核心数字 40 条
- 题目总量 4,460 = Text 2,455 + MM 2,005(HF 逐行实测与论文 Table 1 双源一致)。
- MM 子集图像 2,839 张(论文 §3 口径;第三方实测 2,852,差异 13 张未决,坑点 7)。
- Text split:dev 5 / test 2,450;MM split:dev 5 / test 2,000。
- 选项形式:Text 10 选 1、MM 5 选 1;随机基线 10% / 20%。
- 构建漏斗:37,543 → 4,683(Text 2,578 + MM 2,105)→ 4,460,保留率约 11.9%。
- 文件字节实测:Text/dev 13,465 B;Text/test 4,163,223 B;MM/dev 8,254 B;MM/test 2,017,059 B;images.zip 517,130,457 B。
- HF usedStorage 520,420,025 B;revision 7e7c465a68eb2b866926bfa59c8c9d17a8daba65。
- MM test question_type:Reasoning 1,446 / Understanding 554。
- Text test question_type:Reasoning 1,861 / Understanding 589。
- MM test medical_task:Diagnosis 1,199 / Treatment 448 / Basic Science 353。
- Text test medical_task:Diagnosis 1,050 / Treatment 746 / Basic Science 654。
- MM test body_system 12 取值:Skeletal 491、Cardiovascular 320、Nervous 231、Integumentary 225、Respiratory 192、Digestive 168、Reproductive 98、Lymphatic 81、Endocrine 74、Urinary 56、Muscular 46、Other/NA 18。
- 每题图像 1 至 6 张,均值 1.43;分辨率 323×34 至 4248×2144;图像 10 类。
- 人类分层过滤:adaptive Brier score,三档自适应阈值(25th / 3rd 百分位锚定);约 16.78% 题目缺标注未过此关。
- AI 过滤:8 个 AI 专家模型 × 每题 14 次采样投票。
- 增强后选项数:Text 10、MM 5,由两个专有模型(未具名)重写题干并扩充选项。
- 抽检 10%(Text 490 + MM 400 = 890 题),错误题 28 + 11 = 39,错误率约 4.3%。
- 防泄露:PPL 1.03×10²¹⁸(合成前)→ 1.35×10²⁴⁷(合成后),ROUGE-L 与编辑距离同测,结论泄露风险低。
- 人类作答分布:多数题 ≥500 条记录,最高 238k;不足 200 题缺作答数据。
- 人类基线 Expert (Pre-Licensed) MM:41.74 / 45.44 / 平均 42.60。
- o1(MM,10% 抽样 seed=42):46.24 / 39.66 / 平均 44.67——论文中唯一超人类基线的模型。
- GPT-4o:MM 30.37;Text 42.80;跨子集总均 35.96(vanilla LMM 最强)。
- DeepSeek-R1 Text 37.76(R 37.88 / U 37.35)为 LLM 组最强;o3-mini‡ 37.30。
- 其余代表成绩:QVQ-72B 27.06(总)、Claude-3.5-Sonnet 26.65、Gemini-1.5-Pro 26.16、DeepSeek-V3 24.16、Claude-3.5-Haiku 17.76、QwQ-32B-Preview 18.00。
- 推理时扩展三组对照(DeepSeek-R1 对 DeepSeek-V3 等)方向一致:推理模型增益显著。
- 难度反差:o1-preview 在 MedQA-USMLE 96%、MMLU Medical Genetics 99%,在本基准大幅低于此。
- 版本链:arXiv v1 2025-01-30 → v2 2025-02-20 → v3 2025-06-06(ICML camera-ready)。
- 许可:数据集 MIT;论文 CC BY 4.0;仓库 LICENSE 文件 2025-09-07 才补建(滞后约七个月)。
- HF 指标(2026-10-03):downloads 9,628 / likes 65;Google Scholar 引用约 190 次(快照 187、193 与 199)。
- 17 specialties 覆盖 ABMS 25 个 member board 中的 17 个;11 body systems(另有 Other/NA 兜底 18 题)。
- 题源六类:USMLE、COMLEX-USA、17 个专科委员会考试、ACR DXIT 与 TXIT、EDiR、NEJM Image Challenge。
- 作者 9 人:共同一作 Yuxin Zuo 与 Shang Qu;通讯 Ning Ding 与 Bowen Zhou;Qu、Ding、Zhou 三人同时挂上海AI实验室。
- 资助三项:国家科技重大专项 2023ZD0121403、中国科协青年人才托举 2023QNRC001、NSFC No. 62406165。
- HF task_categories 登记为 table-question-answering、question-answering、text-generation;数据卡标签含 medical、question-answering、multimodal、reasoning、expert-level。
- GitHub 评估入口:main.py(多线程推理)+ eval.ipynb(算分);OpenCompass 集成于 2025-04-08(PR #2002)。
- 抓取通道存照:本条目编写经 hf-mirror.com 完成 HF 全量抓取;官方 leaderboard 为 JS SPA,静态抓取不可得。
- 评估设置:官方 few-shot 示例取自各子集 dev 的 5 题;few-shot 与 zero-shot 成绩有系统性差异,不可混排。
- 推理子集:question_type = Reasoning 的子集称 reasoning-oriented subset,用于 o1 类模型专项评估;标签为 gpt-4o 辅助标注。
- 人类基线限定:Expert (Pre-Licensed) 仅有 MM 行;Text 子集未设人类基线行,人机差只能在 MM 上讨论。
- 代码组织:TsinghuaC3I org 下发布;评估两入口 main.py 与 eval.ipynb;README 原文警告 QVQ 与 DeepSeek-R1 的专用清洗。
术语表:缩写与专有名词
| 术语 | 全称与释义 |
|---|---|
| MedXpertQA | 本条目数据集名;Expert-level Medical QA 的合成词 |
| Text / MM | 纯文本子集 / 多模态(Multimodal)子集 |
| USMLE | United States Medical Licensing Examination,美国医师执照考试 |
| COMLEX-USA | Comprehensive Osteopathic Medical Licensing Examination,整骨医学执照考试(含骨科影像特色) |
| ABMS | American Board of Medical Specialties,美国医学专科委员会(25 个 member board) |
| ACR | American College of Radiology,美国放射学会 |
| DXIT / TXIT | ACR 的放射学诊断(Diagnostic)与治疗(Therapy)在训考试 |
| EDiR | European Diploma in Radiology,欧洲放射委员会文凭考试 |
| NEJM Image Challenge | 新英格兰医学杂志图像挑战专栏 |
| MCQ | Multiple-Choice Question,多选题 |
| adaptive Brier score | 基于作答记录的概率预测评分标定法(Zhu et al. 2024) |
| PPL | Perplexity,困惑度;防泄露评估度量之一 |
| ROUGE-L | 基于最长公共子序列的文本重叠度量 |
| few-shot / zero-shot | 提示词中携带示例 / 不携带示例的评估设置 |
| LMM / LLM | 大型多模态模型 / 大语言模型 |
| reasoning at test time | 测试时扩展推理深度(o1 类模型的核心机制) |
| reasoning-oriented subset | question_type = Reasoning 的题目子集 |
| gated | HF 数据集访问控制;本数据集 gated=false 即免登录 |
| revision | HF 数据集版本快照标识(git commit sha) |
| OpenCompass | 上海AI实验室发起的开源评测框架(PR #2002 集成本基准) |
| EvalScope | 阿里系开源评测框架,–datasets medxpertqa 启用 |
| DAIMS | Discoverability / Accessibility / Interoperability / Metadata / Sustainability 五维数据就绪度评估 |
| body system | 人体系统分类(Liachovitzky 2015 体系,11 系统) |
| member board | ABMS 体系下的专科委员会 |
| Expert (Pre-Licensed) | 尚未取得执照的备考医学生群体,本基准人类基线来源 |
| QVQ-72B-Preview | 阿里系多模态推理模型;MM 21.76 / Text 33.55;输出需专用清洗(坑点 8) |
| Muse Spark | Meta Superintelligence Labs 模型;llm-stats 第三方口径 78.4% 居首(非官方) |
| MedGemma | Google 医学专用模型系列,1 与 1.5 版官方报告采用本基准 |
| Lingshu | 阿里 DAMO 医学模型,官方采用方之一 |
| HuatuoGPT-o1 | 医学推理模型工作(arXiv:2412.19437),引文网络锚点 |
| MedReason | 医学推理链数据与方法(arXiv:2504.00993),引文网络锚点 |
| HLE | Humanity’s Last Exam(arXiv:2501.14249),通科极限难度基准 |
| camera-ready | 会议定稿版;本条目成绩以 ICML 2025 camera-ready(v3)为准 |
| main.py / eval.ipynb | 官方评估两入口:多线程推理调度 / 算分与专用答案清洗 |
| plausible distractor | 似真干扰项;选项增强(第四步)的目标产物 |
| Other/NA | body_system 兜底类,MM test 18 题(坑点 3) |
| Seed2.0 / Qwen3.5 | ByteDance Seed 与 Alibaba Qwen 的旗舰模型,官方采用方 |
| EXAONE 4.5 | LG 医学相关模型,官方采用方之一 |
| issue 反馈 | 标注疑问经 GitHub issue 提交,附题目 id 与理由 |
附录
附录 A:条目信息速查卡
| 项 | 值 |
|---|---|
| 条目名 | MedXpertQA |
| url_name | medxpertqa |
| 类型 | 评测基准数据集(MCQ:Text + MM 双子集) |
| 论文 | arXiv:2501.18362,ICML 2025(v3 camera-ready 2025-06-06) |
| 团队 | 清华大学 + 上海人工智能实验室(TsinghuaC3I) |
| 作者 | 9 人;Yuxin Zuo 与 Shang Qu 共同一作;Ning Ding 与 Bowen Zhou 通讯 |
| 规模 | 4,460 题(Text 2,455 + MM 2,005)+ 2,839 张图像 |
| 许可 | 三层:数据集 MIT / 论文 CC BY 4.0 / 题源上游未让渡 |
| 资助 | 2023ZD0121403;2023QNRC001;NSFC No. 62406165 |
| 抓取时点 | 2026-10-03 |
| 库内互链 | medmcqa(111)、headqa(120)、medquad(160)、emrqa(139)、slake(250)、vqa-rad(240)、pathvqa(260)、pmc-vqa(270)、omnimedvqa(290)、ehrxqa(646)、rxqa(719)、medcalc-bench(708)、xmedbench(727)、gmai-mmbench(562)、medhop(754)、chexpert-plus(740)、word(412)、cblue(190)、medmnist(716) |
附录 B:DAIMS 评估全表
| 维度 | 评分(1-10) | 依据 |
|---|---|---|
| D 可发现性 | 9 | arXiv + GitHub + HF + leaderboard 四入口齐全,名称独特无撞库;扣分项:leaderboard 为 JS SPA 不可静态抓取 |
| A 可获取性 | 9 | gated=false 全量直下,总占用约 496 MB,MIT 许可,无注册与申请环节 |
| I 可互操作 | 8 | jsonl 标准 + HF datasets + OpenCompass/EvalScope 双框架官方集成;扣分项:图像为 zip 包需自行对齐文件名,无 parquet 封装 |
| M 元数据质量 | 8 | 论文表格完备(漏斗、分布、成绩),HF 卡字段齐全;扣分项:medical_task 取值不一致(坑点 2)、specialty 无逐题字段、17 专科无逐一清单 |
| S 可持续性 | 8 | 学术机构维护 + 四大实验室采用形成生态锁定;扣分项:LICENSE 补建滞后七个月的先例、leaderboard 单点 |
| 综合评级 | 8.4/10(高) | 获取与互操作接近满分;元数据的口径瑕疵是主要失分点,均已在本条目存照 |
附录 C:逐项证据链自证
| 关键数字 | 来源 | 位置 |
|---|---|---|
| 4,460 / 2,455 / 2,005 | 论文 Table 1 + HF 四文件逐行实测 | 双源一致 |
| 37,543 → 4,683 → 4,460 漏斗 | 论文 Table 1 | 论文 §3 |
| 2,839 张图像 / 10 类 / 均值 1.43 | 论文 §3 | 论文正文 |
| 文件字节与 revision | HF API(经 hf-mirror 实抓) | 本条目编写时实测 |
| test 集字段分布(task/type/body_system) | 四文件逐行统计 | 本条目编写时实测 |
| 人类基线 42.60 与 o1 44.67 | 论文 Table 4 | 论文 §4 |
| 错误率 4.3%(39/890) | 论文 §3.4 | 论文正文 |
| PPL 1.03×10²¹⁸ → 1.35×10²⁴⁷ | 论文 §5.1 | 论文正文 |
| 16.78% 缺标注 | 论文(adaptive Brier 段) | 论文 §3 |
| 模型阵容与 ‡ 抽样标注 | 论文 §4.2 与 Table 4 脚注 | 论文正文 |
| 采用清单 | GitHub README Benchmark Adoption | 仓库实抓 |
| MIT / CC BY 4.0 / LICENSE 滞后 | GitHub LICENSE + HF cardData + arXiv 页脚 + 提交史 | 多源互证 |
附录 D:研究者检查清单(15 项)
- 锁版本:所有实验固定 HF revision 7e7c465a68eb2b866926bfa59c8c9d17a8daba65,并在论文中注明。
- 分子集报告:Text 与 MM 分开报,注明选项数(10 选 1 / 5 选 1),不做跨子集差值(坑点 6)。
- 抽样限定:引用 o1 或 o3-mini 成绩必须带「10% 抽样、seed=42」(坑点 5)。
- 口径声明:模型数量按论文摘要 18 引用并注 README 口径 17(坑点 1)。
- 字段兼容:过滤脚本同时接受 Basic Science 与 Basic Medicine 两种取值(坑点 2)。
- 兜底类处理:body_system 分层统计单列 Other/NA 18 题(坑点 3)。
- 专用清洗:复现 QVQ 与 DeepSeek-R1 使用 eval.ipynb 专用逻辑(坑点 8)。
- 设置统一:few-shot(5 题 dev)与 zero-shot 不得混排对比。
- 许可分层:数据声明写 MIT;论文引用按 CC BY 4.0;图像商用做上游权利评估(坑点 4)。
- 榜单来源:官方数字引论文 Table 4 或 GitHub README;第三方榜单(llm-stats 等)显式标注非官方口径(坑点 7、坑点 8)。
- 子集命名:报告里区分 MedXpertQA Text 与 MedXpertQA MM,勿简写为单一「MedXpertQA 分数」。
- 人类基线限定:人机差只在 MM 上讨论,Text 无人类基线行(§7.2)。
- 翻译自建:翻译版成绩独立成口径,不与原版混排(问 38)。
- dev 用途:5 题 dev 只作 few-shot 示例,不入 test 统计(§3.1)。
- 引用双源:成绩引论文 Table 4,数据引 HF revision,两者缺一不可(附录 C)。
附录 E:AI-Ready 就绪度对照
| 检查项 | 状态 | 说明 |
|---|---|---|
| F1 元数据唯一标识 | 通过 | HF dataset 卡 + 论文 doi + revision 三重标识 |
| F2 结构化格式 | 通过 | jsonl 逐行 JSON,字段 schema 明确 |
| F3 领域词汇引用 | 通过 | body_system 用标准生理学体系;medical_task 对齐考试大纲 |
| A1 可访问协议 | 通过 | HTTPS 直链 + HF API,gated=false |
| A2 元数据可访问 | 通过 | 元数据与数据同址开放 |
| I1 互操作格式 | 通过 | jsonl + zip 图像,主流框架原生支持 |
| I2 词汇表引用 | 部分通过 | medical_task 取值不一致(坑点 2)需下游兼容 |
| R1 来源溯源 | 通过 | 六类题源在论文 §3.2 明示 |
| R2 许可明示 | 部分通过 | MIT 明确但曾滞后七个月(坑点 4) |
| R3 可复现流程 | 通过 | 评估代码开源 + 双框架集成 + 官方警告齐备 |
| AI-Ready 综合 | 高 | 五维 DAIMS 8.4/10;元数据口径瑕疵均已存照可绕行 |
附录 F:版本与快照对照
| 对象 | 版本/时点 | 说明 |
|---|---|---|
| 论文 | v1 2025-01-30 / v2 2025-02-20 / v3 2025-06-06 | v3 为 ICML camera-ready,本条目成绩依据 |
| HF 数据集 | createdAt 2025-02-08 / lastModified 2025-07-09 | revision 7e7c465a68eb2b866926bfa59c8c9d17a8daba65 |
| GitHub LICENSE | 2025-02 建库 / 2025-09-07 补建 | 滞后约七个月(坑点 4) |
| OpenCompass 集成 | 2025-04-08(PR #2002) | 评估框架生态起点 |
| Google Scholar 引用 | 快照 187、193 与 199 | 建议写「约 190 次」并注时点 |
| HF 指标 | downloads 9,628 / likes 65 @ 2026-10-03 | 热度参考 |
| llm-stats 第三方榜单 | 2026-06 更新,12 模型 | 非官方口径(坑点 8) |
附录 G:常见误读十纠
- 误读「人类医学专家只有 42 分」——42.60 是备考执照的医学生在「专为其保留难题」的题集上的聚合基线,且仅 MM 子集有此行;不是执业医师的能力评分。
- 误读「o1 得 44.67 是全量成绩」——10% 抽样(seed=42),引用必须带限定(坑点 5)。
- 误读「MM 分低说明多模态能力差」——MM 与 Text 难度参数不同,跨子集差值不构成定量结论(坑点 6)。
- 误读「4,460 题全是新造的」——题源是真实考试与题库,增强是改写与选项扩充,且有医师审核兜底;「合成」仅指增强环节。
- 误读「MIT = 题源无任何权利主张」——许可三层,上游考试主办方权利未被显式让渡(坑点 4)。
- 误读「dev 只有 5 题是数据残缺」——few-shot development set 的刻意设计(论文 §3.1)。
- 误读「官方榜单可以脚本爬取」——JS 渲染 SPA,静态抓取返回空页(坑点 7)。
- 误读「llm-stats 的 78.4% 是官方口径」——第三方社区实测,模板与子集均不同(坑点 8)。
- 误读「17 个专科有逐一清单」——论文与 README 只给「17/25 member board」总数口径,逐一名单属待核事项。
- 误读「图像数两个口径随便用」——条目统一按论文 2,839 表述并注第三方实测 2,852(坑点 7),同一文档内混用会造成统计不一致。
附录 H:章节-事实覆盖自查表
编写时以下列对应关系保证「每个关键事实至少落位两章」,读者可按此表反向核对:
| 事实簇 | 主章节 | 交叉章节 |
|---|---|---|
| 规模与文件 | §3.1 | §0、§4.1、附录 A |
| 漏斗与五步 | §5.1、§5.2 | §1 问 5、§5.3、§5.7 |
| 成绩与基线 | §7.2 | §1 问 7、§7.3、§7.5 |
| 许可三层 | §6.1 | §1 问 6、坑点 4、附录 D |
| 采用与生态 | §2.3、§8.3 | §0、§8.1、§8.4 |
| 口径存照 | §9 | 全文各坑点交叉引用 |
附录 I:下载与加载代码骨架
import os, json, urllib.request
os.environ.setdefault("HF_ENDPOINT", "https://hf-mirror.com") # 受限网络用镜像;主站可达可删
BASE = "https://hf-mirror.com/datasets/TsinghuaC3I/MedXpertQA/resolve/main"
FILES = ["Text/dev.jsonl", "Text/test.jsonl", "MM/dev.jsonl", "MM/test.jsonl"]
def fetch(path, out):
req = urllib.request.Request(BASE + "/" + path,
headers={"User-Agent": "qfh-research/1.0"})
with urllib.request.urlopen(req, timeout=120) as r, open(out, "wb") as f:
f.write(r.read())
for p in FILES:
fetch(p, p.replace("/", "_"))
def load(fn):
with open(fn, encoding="utf-8") as f:
return [json.loads(line) for line in f if line.strip()]
text_test = load("Text_test.jsonl") # 断言 len == 2450
mm_test = load("MM_test.jsonl") # 断言 len == 2000
# 图像(仅 MM 需要):fetch images.zip 后 zipfile 解压,按 images 字段文件名关联
校验点:行数 5/2,450/5/2,000;字节 13,465/4,163,223/8,254/2,017,059;images.zip 517,130,457 B。三项对上即与条目实测版本一致。
附录 J:评估复现检查单(12 项)
- 固定 revision 7e7c465a68eb2b866926bfa59c8c9d17a8daba65(2025-07-09)。
- 行数断言 4,460(附录 I 校验点)。
- label 与 options 键集合全量断言(Text A-J、MM A-E)。
- Text 与 MM 分开统计,不合并平均(坑点 6)。
- 声明随机基线:Text 10%、MM 20%。
- 复用官方 eval.ipynb 或 OpenCompass/EvalScope,不自写答案清洗(坑点 8)。
- QVQ 与 DeepSeek-R1 走专用清洗路径。
- 引用 o1/o3-mini 带「10% 抽样 seed=42」限定(坑点 5);自跑全量须声明非论文口径。
- few-shot 样例只取对应子集 dev。
- 图像路径按 images 字段文件名拼接,勿按 id 猜测。
- medical_task 分层兼容 Basic Science 与 Basic Medicine 双取值(坑点 2)。
- 成绩脚注标明评估日期、模型版本与子集口径。
附录 K:四 split 全分布总表(实测 2026-10-03)
| split | n | Reasoning | Understanding | Diagnosis | Treatment | 基础类 | 选项数 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Text/dev | 5 | 4 | 1 | 3 | 2 | — | 10 |
| Text/test | 2,450 | 1,861 | 589 | 1,050 | 746 | Basic Science 654 | 10 |
| MM/dev | 5 | 4 | 1 | 2 | 2 | Basic Medicine 1 | 5 |
| MM/test | 2,000 | 1,446 | 554 | 1,199 | 448 | Basic Science 353 | 5 |
MM/test body_system:Skeletal 491(24.6%)、Cardiovascular 320、Nervous 231、Integumentary 225、Respiratory 192、Digestive 168、Reproductive 98、Lymphatic 81、Endocrine 74、Urinary 56、Muscular 46、Other / NA 18。骨骼近四分之一来自 COMLEX 骨科特色与放射来源——「全身均衡」分层实验前先对齐此分布(坑点 3 关联)。
附录 L:与库内医学 MCQ 基准对比总表
| 维度 | MedXpertQA(本条目) | MedMCQA(111) | HeadQA(120) | MedQA 同类(库内无条目) |
|---|---|---|---|---|
| 语言 | 英文 | 英文 | 西班牙语/英语 | 英文 |
| 考试层级 | 执照 + 专科委员会 | 印度 AIIMS/NEET-PG | 西班牙 MIR | USMLE |
| 题量 | 4,460 | 约 19.4 万 | 千至万级 | 约 1.2 万 |
| 选项数 | 10 / 5 | 4 | 4-5 | 4-5 |
| 随机基线 | 10% / 20% | 25% | 20-25% | 25% |
| 多模态 | 有(2,839 图) | 无 | 无 | 无 |
| 人类作答背书 | 有(多数题 ≥500 条) | 无系统公开 | 部分 | 无系统公开 |
| 防泄露机制 | 改写 + 扩选项 + 三指标检验 | 无 | 无 | 无 |
| 定位 | 难度顶点 / 专家级 | 规模最大 / 学生级 | 跨语言小样本 | 已被打穿的旧标杆 |
附录 M:论文对五个传统多模态基准的批评对照
| 基准(rid) | 年份 | 论文批评要点(§1 归纳) | MedXpertQA MM 对应设计 |
|---|---|---|---|
| VQA-Rad(240) | 2018 | 范围窄、难度不足,只测基础视觉感知 | 执照级真题 + 病历形态题干 |
| Path-VQA(260) | 2020 | 图像标题自动生成的简单 QA 对 | 考试真题人工收集 + 医师审核 |
| Slake(250) | 2021 | 与真实临床场景脱节 | 题干嵌入病历与检查结果 |
| PMC-VQA(270) | 2023 | 缺临床相关性,忽略诊疗决策复杂度 | 诊断/治疗/基础三类覆盖 |
| OmniMedVQA(290) | 2024 | 多源拼盘、同质化简单题 | 17 专科 × 11 系统纵深网格 |
两层评测栈读法:五条传统基准筛查图文对齐底线,本条目度量距临床可用的差距——互补而非替代。
附录 N:库内互链条目分工详表(19 条)
| 条目(rid) | 类型 | 与本条目的分工 |
|---|---|---|
| medmcqa(111) | 文本 MCQ | 量大面广(约 19.4 万)对标难度纵深(4,460) |
| headqa(120) | 文本 MCQ | 西班牙语跨语言对照 |
| medquad(160) | 问答对 | 消费者级医学问答,非考试形态 |
| emrqa(139) | 问答框架 | EHR 问答任务框架,无考题难度属性 |
| slake(250) | 多模态 VQA | 传统感知层基准(论文点名) |
| vqa-rad(240) | 多模态 VQA | 同上(论文点名) |
| pathvqa(260) | 多模态 VQA | 同上(论文点名) |
| pmc-vqa(270) | 多模态 VQA | 同上(论文点名) |
| omnimedvqa(290) | 多模态 VQA | 同上(论文点名) |
| ehrxqa(646) | EHR 问答 | 结构化 EHR 时序推理互补 |
| rxqa(719) | 药物 QA | 药物知识垂直能力 |
| medcalc-bench(708) | 计算推理 | 医学计算类垂直能力 |
| xmedbench(727) | 综合评测 | 通用医学能力横评 |
| gmai-mmbench(562) | 多模态综合 | 通用医疗多模态(广义科室覆盖) |
| medhop(754) | 多跳推理 | 多跳阅读理解互补 |
| chexpert-plus(740) | 影像报告 | 影像报告结构化(非 MCQ) |
| word(412) | 内镜数据集 | 影像本体(非评测) |
| cblue(190) | 中文医疗 NLP | 中文医学语言任务 |
| medmnist(716) | 影像分类 | 轻量影像基准(AI-Ready 同档开放度) |
附录 O:多口径集中登记表
| 编号 | 事项 | 口径 A | 口径 B | 口径 C | 采信建议 |
|---|---|---|---|---|---|
| N1 | 评估模型数 | 18(论文摘要) | 17(GitHub README) | 16(HF 论文页贴文) | 论文 v3 的 18;引 README 注 17 |
| N2 | 基础类取值 | Basic Science(test 实测) | Basic Medicine(dev 实测 + 文档) | — | 过滤代码匹配双取值 |
| N3 | 人体系统数 | 11(论文) | 12 取值(实测含 Other/NA) | — | 写 11 系统 + 兜底 |
| N4 | 许可 | MIT(数据集) | CC BY 4.0(论文文本) | 题源上游未让渡 | 分层引用(坑点 4) |
| N5 | 引用数 | 187(快照 1) | 199(快照 2) | 193(快照 3,2026-10-04 复核) | 写「约 190」并注时点 |
| N6 | MM 图像数 | 2,839(论文) | 2,852(evalscope 第三方实测) | — | 引论文口径注第三方(坑点 7) |
| N7 | o1 成绩 | MM 抽样 44.67(论文) | 第三方榜单另有口径 | — | 只引论文 + 抽样限定 |
附录 P:维护计划与触发点
| 触发事件 | 维护动作 |
|---|---|
| HF sha 变化(新 split/字段) | 重跑附录 I 校验,更新 §3 分布与附录 K |
| 论文 v4+ 或期刊版 | 核对阵容与成绩表,更新坑点 1 |
| GitHub LICENSE/README 变更 | 核对许可与采用清单,更新 §6 与坑点 4 |
| 评测框架破坏性更新 | 复验附录 J 第 6/7 项 |
| N6 图像数分歧获官方裁定 | 更新坑点 7 与附录 O |
| 期刊版发表 | 增补正式出版信息与引用格式 |
附录 Q:成绩引用合规句式库(10 式)
- 「在 MedXpertQA Text 子集(十选一)上,DeepSeek-R1 全量平均 37.76%。」
- 「o1 在 MedXpertQA MM 子集的 10% 抽样评估(seed=42)中平均 44.67%,为论文中唯一超过人类基线的模型。」
- 「人类基线 Expert (Pre-Licensed)——备考美国执照考试的医学生人群——在 MM 子集平均 42.60%。」
- 「GPT-4o 在 MM 子集平均 30.37%(随机基线 20%)。」
- 「论文共评估 18 个模型(arXiv v3 摘要口径;GitHub README 现行 17 个)。」
- 「MM 与 Text 子集因选项数与过滤参数不同,成绩不可直接比较(论文原文声明)。」
- 「构建漏斗 37,543 → 4,683 → 4,460(论文 Table 1),终稿抽检错误率约 4.3%。」
- 「数据集为 MIT 许可(HuggingFace TsinghuaC3I/MedXpertQA,revision 7e7c465a)。」
- 「第三方榜单(llm-stats,2026-06)Muse Spark 78.4% 为社区实测口径,与论文不可混排。」
- 「本条目成绩均指多选题准确率(Acc%),不外推至临床诊疗能力。」
附录 R:生产环境与命令清单(可复现实录)
# 数据实测(hf-mirror 全链路)
curl -s https://hf-mirror.com/api/datasets/TsinghuaC3I/MedXpertQA
curl -s https://hf-mirror.com/datasets/TsinghuaC3I/MedXpertQA/raw/main/README.md
curl -sL https://hf-mirror.com/datasets/TsinghuaC3I/MedXpertQA/resolve/main/Text/test.jsonl -o Text_test.jsonl
wc -l Text_test.jsonl # 2450
curl -sL https://hf-mirror.com/datasets/TsinghuaC3I/MedXpertQA/resolve/main/MM/test.jsonl -o MM_test.jsonl
wc -l MM_test.jsonl # 2000
# 论文全文(ar5iv 与 export.arxiv.org 在本环境不可达)
curl -sL -A "Mozilla/5.0" https://arxiv.org/html/2501.18362v3 -o paper.html
# slug 查重(库内,只读)
bash scripts/qf_psql.sh "SELECT record_id,url_name FROM ai_ready_dataset WHERE status=1 AND url_name ILIKE '%medxpertqa%';"
沙箱可达性存照:hf-mirror.com 全通;arxiv.org /abs/ 与 /html/ 可达;huggingface.co 主站、ar5iv、export.arxiv.org 不可达;medxpertqa.github.io 为 JS SPA 空页;Semantic Scholar 429 限流(引用数改经 Google Scholar 快照双值存照)。
附录 S:中英术语对照
| 英文 | 中文 | 备注 |
|---|---|---|
| expert-level | 专家级 | 对齐执照与专科委员会考试层级 |
| specialty board | 专科委员会(考试) | ABMS 体系,覆盖 17/25 |
| body system | 人体系统 | 11 个 + Other/NA |
| reasoning-oriented subset | 推理导向子集 | question_type=Reasoning |
| distractor | 干扰项 | 增强阶段删除低质干扰项 |
| data leakage | 数据泄露 | PPL/ROUGE-L/编辑距离三指标检验 |
| inference-time scaling | 推理时扩展 | o1 类测试时算力换精度范式 |
| pre-licensed | 执照考前(人群) | 人类基线来源身份 |
| gating | 准入门控 | HF gated=false 即免审直下 |
| revision | 数据版本号 | 固定 sha 保可比 |
| board certification | 专科委员会认证 | ABMS member board 资质体系 |
| few-shot development set | 小样本开发集 | 每子集 5 题 |
附录 T:字段数据字典(JSONL 逐字段)
{
"id": "MM-26", // string,子集前缀+编号;test 内唯一
"question": "A 70-year-old female ... Answer Choices: (A) ... (E) ...",
// string,题干;文末内嵌 Answer Choices 全文(与 options 冗余)
"options": { // dict<string,string>,字母键 -> 选项文本
"A": "Erythema infectiosum",
"B": "Cutaneous larva migrans",
"C": "Cold agglutinin disease",
"D": "Cutis marmorata",
"E": "Erythema ab igne" // MM 恒 5 键(A-E);Text 恒 10 键(A-J),全量实测一致
},
"label": "C", // string,单字母正确答案;打分与 options 键精确比对
"images": ["MM-26-a.jpeg"], // string[],仅 MM 有;Text 记录为缺省键而非空数组
"medical_task": "Diagnosis", // string;Basic Science / Basic Medicine 双取值并存(坑点 2)
"body_system": "Lymphatic", // string;11 系统 + Other / NA(坑点 3)
"question_type": "Reasoning" // string;gpt-4o 按 prompt 标注
}
工程注记五条:其一,question 与 options 信息冗余,构造 prompt 二选一,勿拼两份选项清单;其二,Text 记录用 .get("images", []) 防键错误;其三,label 是键不是文本,精确比较即可;其四,body_system 取值含空格斜杠(Other / NA),枚举映射注意精确串;其五,四文件均 UTF-8 无 BOM,逐行 json.loads 零失败(实测)。
尾注:来源、时点与编写声明
本条目全部事实性内容基于以下来源,抓取时点 2026-10-03:论文 arXiv:2501.18362(v3,含 Table 1/4 与 §3/§4/§5);GitHub 仓库 TsinghuaC3I/MedXpertQA(README、LICENSE、提交史);HuggingFace 数据集 TsinghuaC3I/MedXpertQA(API 元数据、数据卡与四文件全量逐行统计,经 hf-mirror.com 通道);官方 leaderboard 与 llm-stats.com 分别按坑点 7、坑点 8 的口径存照。
编写口径:所有数字保留原始精度,不做四舍五入改写;论文口径与实测口径冲突时按 §9 坑点存照处理并双注;待核事项(17 specialties 逐一名单、8 个 AI 专家模型清单、图像总数 13 张差异)均已在 §9 与事实层面显式标注,后续版本获得新证据时更新。本条目由千方病案医数集编写组撰述,遵循数据集 MIT 许可与论文 CC BY 4.0 的引用要求。
编写方法声明:本条目按 AI-Ready Wikipedia 规范撰述——各章可独立引用;关键数字均带章节回链(如「十个数字记忆卡」的展开位置列);八处坑点构成引用前的强制检查面;DAIMS 评分(附录 B)为编写组基于多源核验的编者评估,非官方声明;条目结构与 frontmatter 遵循千方病案医数集条目模板(schema_org 含 cr:RecordSet 与 rai:dataLimitations)。
条目版本记录:v1.0(2026-10-03)初版——基于论文 v3、GitHub README 与 HF 全量实测的三源核验完成;坑点八条、事实四十条、FAQ 四十问、DAIMS 8.4/10。v1.0.1(2026-10-04)agent-d-medxpertqa-v2 接管复核修订——title 按 S2 规则补齐「— 中文副标题 —」段;修正四处章节编号重复(5.6、7.5、8.4、附录 H 各出现两次,后者分别改为 5.8、7.8、8.5、附录 T);Google Scholar 引用数增补第三快照 193(2026-10-04 复核)。后续更新规则:仅在获得官方新版本(论文 v4、数据集新 revision、README 口径变更)或新证据(17 专科清单、AI 专家模型名单、图像总数差异落定)时升版,升版须更新附录 F 快照对照并重跑坑点核验。
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